假暗叶山榄（大戟科）的染色体级基因组组装与注释

《Scientific Data》：Chromosome-scale genome assembly and annotation of Glochidion pseudo-obscurum (Phyllanthaceae)

　　

摘要

Glochidion pseudo-obscurum属于叶下珠科Phyllantheae族，分布于Glochidion属的最北端附近。许多Glochidion物种与Epicephala蛾类存在必需的授粉互惠关系，因此G. pseudo-obscurum是研究在该属分布边缘此类特化相互作用如何维持或变化的理想对象。在本研究中，我们利用Hi-C技术结合PacBio HiFi和DNBSEQ-T7测序数据，构建了Glochidion pseudo-obscurum的染色体级基因组。该基因组总大小为1.04吉字节，其中95.34%（993.37吉字节）分布在26条假染色体上。其染色体级基因组的支架N50长度为39.44吉字节，BUSCO完整度评分达到97.3%。该基因组中80.57%（800.39吉字节）为重复序列，共编码34,117个预测的蛋白质编码基因，BUSCO完整性评分为94.0%。这一染色体级基因组组装及注释结果为研究Glochidion的功能基因组学及进化历史提供了重要资源，同时也有助于探讨叶下珠植物与其授粉蛾类的协同进化关系。