整合性血液转录组学在临床前帕金森病中发现了U1-snRNP基因的抑制作用以及miRNA与mRNA的调控网络

《npj Parkinson's Disease》：Integrative blood transcriptomics identifies U1-snRNP gene repression and miRNA–mRNA regulatory hubs in pre-clinical Parkinson’s disease

　　

摘要

帕金森病是一种进行性神经退行性疾病，其特点为多巴胺能神经元的丢失以及神经元内错误折叠的α-突触核蛋白聚集体的积累。尽管人们对帕金森病的潜在分子机制有了更多了解，但目前的诊断仍主要依赖于在疾病进展后期才出现的临床症状。为了进一步深入理解帕金森病的发病机制并开发新的诊断工具，我们对帕金森病进展标志物研究计划中的2604名参与者（健康人群=658；帕金森病患者=1946）的匹配全血mRNA测序和miRNA测序数据进行了综合分析，这些参与者被分为临床前期（=561）、轻度、中度和重度四个阶段。差异表达分析（调整后p值<0.05；倍数变化|>0.58）显示，临床前期和重度帕金森病患者的基因表达变化最为显著（分别有7386个基因和156个miRNA出现差异表达）。临床前期的特征表现为大量基因表达下调，尤其是多个U1 snRNA基因，这表明U1-snRNP剪接体成分在早期就已经受到抑制。通过将预测的靶标与斯皮尔曼相关分析相结合，我们找到了251对miRNA与mRNA之间的关联，其中起关键作用的miRNA包括miR-34a-5p、miR-1299、miR-3120-5p和miR-412-3p。总体而言，这些研究结果强调了临床前期帕金森病中剪接体功能障碍和miRNA失调的重要性，也为它们作为新型血液生物标志物提供了依据。