哺乳类动物神经系统与生殖系统间桥接基因的多物种鉴定

《iScience》:Across species identification of genes bridging neurological and reproductive functions in mammals

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年08月13日 来源:iScience 4.5

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  哺乳动物的进化成功依赖于神经系统与生殖系统功能的协调,这很可能由脑与生殖细胞(精子/睾丸、卵巢)之间共享的基因与分子通路所介导。然而,跨物种的直接证据仍然有限。研究人员在绵羊(Ovis aries)与大鼠(Rattus norvegicus)中实验性开展了蛋白

  
哺乳动物的进化成功依赖于神经系统与生殖系统功能的协调,这很可能由脑与生殖细胞(精子/睾丸、卵巢)之间共享的基因与分子通路所介导。然而,跨物种的直接证据仍然有限。研究人员在绵羊(Ovis aries)与大鼠(Rattus norvegicus)中实验性开展了蛋白质组学与转录组学分析,同时对小鼠(Mus musculus)、猕猴(Macaca mulatta)与人类(Homo sapiens)的转录组数据集进行计算机(in silico)分析。研究人员鉴定出8464个在脑与精子/睾丸中共有且于五物种间保守的蛋白质编码基因。在大鼠中,这些基因里有8444个亦在脑与卵巢间共有。功能注释将3890个基因归类为同时关联神经与生殖功能,1752个在此背景下功能未明,从而为生殖与神经疾患的未来研究标定了候选基因。这些发现确立了一组在神经与生殖系统间共享的保守基因,暗示了支撑这些系统间分子功能进化保守性的潜在遗传网络。
研究背景与立项依据
哺乳动物进化成功被认为依赖神经适应与生殖适合度的协同。已有零星证据提示脑与睾丸在基因表达上高度相似,且单基因多效性(pleiotropy)如HTT、FMR1可同时影响神经退行与生育;但既往研究多为in silico、单组织配对、缺卵巢轴与跨物种保守量化。本研究在《iScience》发表,旨在以实验+计算混合框架,系统回答脑–精子/睾丸–卵巢是否共享跨物种保守基因集及其功能注释结构。
主要技术方法概述
研究人员在五雄绵羊采集10个脑区、精子与白细胞(WBC)做bottom-up蛋白质组与RNA-Seq;在22只大鼠(含14雌鼠)做脑–精子及脑–卵巢RNA-Seq;对小鼠、猕猴、人自三个公共库取脑与睾丸/精子转录本做in silico交叉比对。以≥10倍变化与FDR校正q<0.05定差异,整合10个注释库做KEGG与生物过程富集,用PCA、层次聚类与Venn评估保守性与表达相似性。
研究结果
脑与精子在绵羊和大鼠蛋白质与基因表达高度相似
绵羊10脑区蛋白聚为整体簇,精子略偏但相近;4072定量蛋白中脑–精共享2493(61.2%)。转录层21794表达基因中14955(68.6%)脑区–精子共享。大鼠22081表达基因中16072(72.1%)脑–精共享。证明该相似非单物种偶然。
脑、精子与睾丸共有基因跨物种进化保守
并入小鼠、猕猴、人in silico数据后,8464个蛋白质编码基因在五物种脑–精/睾丸共有。人特异性最多(6604),小鼠最少(1406)。KEGG顶端富集神经退行(神经退行-多病、ALS、阿尔茨海默病),并含免疫与生殖过程。8464中7061(83%)五物种间表达水平相似(≥10倍变化内)。
共有基因表达水平跨物种保守
各物种内脑vs精/睾丸差异基因极少(绵羊510、大鼠452、小鼠511、猕猴326、人457)。PCA中PC1(52.5%)将人、鼠、猴、大鼠聚拢,绵羊略分;PC2仅12.5%。说明共有集不仅“有”而且“怎么用”也保守。
脑–卵巢与脑–精子基因跨物种高保守比对
大鼠雌鼠脑–卵巢共享17794基因,其中8444落入五物种脑–精保守集(8464中几乎全含)。大鼠脑–卵巢分别与绵羊(10799)、大鼠(15518)、小鼠(11820)、猕猴(11496)、人(13052)脑–精/睾丸集重叠。提示神经–生殖共享网络不限于雄性。
跨物种脑–精/睾丸基因整合功能注释凸显神经与生殖功能
8464基因四分:仅神经2293(27%)、仅生殖533(6%)、双关3890(46%)、未明1752(21%)。双关集含HTT、FMR1、CAMK2A等已知多效基因,证实注释结构偏向“同一基因两系统复用”而非随机重叠。
讨论与结论翻译
讨论指出,哺乳类进化成功的一环是神经与生殖系统经保守基因网络协调;脑–垂体–性腺轴、SOX9/DMRT等发育调控因子、局部免疫豁免转录组共同塑造该重叠。本研究首以实验+in silico证得五物种8464基因保守共享,绵羊因Laurasiatheria较早分歧(约9000万年前与Euarchontoglires分开)而相似度稍低;大鼠中8444/8464亦见于脑–卵巢,将“脑–睾丸”拓展为“脑–生殖”双侧轴。3890双关与1752未明基因构成未来神经–生殖共病(不孕、智障、退行)候选源。
结论:研究人员鉴定出8464个五物种脑与精子/睾丸共有保守蛋白质编码基因,其中8444亦在大鼠脑–卵巢共有;3890具神经+生殖双注释、1752未明;该集表达量级跨物种稳定,暗示一支撑分子功能进化保守的遗传网络介于神经与生殖系统之间。
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