基于单倍型的基因组区域验证，用于培育新的北欧苹果品种

《Hereditas》：Haplotype-based validation of genomic regions for breeding of new Nordic apples

　　

摘要

在为高纬度地区培育苹果品种时，为了应对较短的生长季节和不断变化的气候条件，提早收获和延迟开花是非常重要的。根据不同用途的需求，多酚含量的高低可能有所不同：在制作果汁和苹果酒时，较高的多酚含量是理想的，而在培育甜点用苹果时，则可能不太理想。因此，我们在瑞典、挪威和芬兰的三个北欧地区，对111、189和88个苹果基因型进行了表型分析，分别检测其收获日期、开花日期以及果皮中原花青素B2的浓度。利用20 K苹果Infinium^? SNP阵列提供的相位标记数据，我们对之前确定的定量性状位点区间及基因组区域进行了单倍型验证，这些区域分别位于连锁群3（收获日期）、连锁群9和12（开花日期）以及连锁群16（PRB2浓度）。我们还分析了这些性状与历史气候适应性之间的关联，并找到了与这三种性状的正向或负向效应相关的单倍型。这些结果对于北欧地区的苹果育种计划中的标记辅助亲本选择具有重要价值，有助于设计出能够适应当前及未来气候条件、并具备良好果实品质的苹果品种，无论是用于培育新的甜点用苹果，还是用于生产果汁或苹果酒的苹果品种。