《Holistic Integrative Oncology》：Bibliometric analysis of research on liver cancer and single?cell RNA sequencing: evolutionary trends, opportunities, and future perspectives
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**目的**：本文献计量分析系统性地描绘了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肝癌（LC）研究中不断演化的研究格局。研究人员总结了全球发表趋势，识别了关键贡献者与合作网络，并追踪了研究热点随时间的发展。
**方法**：从Web of Science核心
**目的**：本文献计量分析系统性地描绘了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肝癌（LC）研究中不断演化的研究格局。研究人员总结了全球发表趋势，识别了关键贡献者与合作网络，并追踪了研究热点随时间的发展。
**方法**：从Web of Science核心合集（WoSCC）中检索2017年至2025年间发表的与scRNA-seq在LC研究中相关的出版物。使用Bibliometrix、CiteSpace和VOSviewer等工具进行文献计量分析，分析内容包括发表趋势、国家与机构贡献、合作网络、作者、期刊以及研究热点的演化。
**结果**：共纳入979篇出版物，显示年发表量快速增长。中国是主要贡献者，其次是美国，中国机构在研究产出中领先。关键词演化分析显示了一条清晰的轨迹：最初的研究聚焦于转录组图谱构建，随后进展到肿瘤微环境（TME）表征，当前正转向解析动态细胞间通讯、细胞外囊泡和基因调控网络，以识别新的治疗靶点和生物标志物。
**结论**：这些发现勾勒了该领域的历史轨迹，并揭示了基于scRNA-seq的LC研究的新兴前沿。本文献计量分析为scRNA-seq在LC研究中快速发展的领域提供了全面概述。研究结果突出了从描述性细胞编目向动态TME和细胞间通讯关注的清晰进展，强调了该技术在推动转化发现中的关键作用。
**论文解读：单细胞RNA测序在肝癌研究中的文献计量学分析——演化趋势、机遇与未来展望**
**研究背景与目的**
肝癌（LC），尤其是肝细胞癌（HCC），是世界上最常见的恶性肿瘤之一，其发病率和死亡率持续上升，严重威胁公共卫生。肝癌的复杂发病机制和巨大的肿瘤内及肿瘤间异质性给有效诊断和治疗带来了巨大挑战。单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术自2009年问世以来，能够以前所未有的分辨率描绘细胞和分子图谱，彻底改变了人们对肝癌等疾病的理解。然而，该领域文献数量快速增长，研究热点不断演变，亟需一次系统的文献计量分析来总结当前状态、识别研究热点并预测未来趋势。该论文发表在《Holistic Integrative Oncology》上，旨在通过分析全球发表趋势、国家/机构/作者贡献、合作网络以及关键词演化，为研究人员和临床医生提供有价值的见解。
**关键技术与方法**
研究人员从Web of Science核心合集（WoSCC）中检索了2017年至2025年间与scRNA-seq和肝癌相关的文献，共纳入979篇出版物（包括933篇论文和46篇综述）。主要分析工具包括Bibliometrix 5.0、CiteSpace 6.1R6和VOSviewer 1.6.20，用于分析发表趋势、国家/机构贡献、合作网络、作者、期刊以及关键词共现与演化。此外，还使用R和Python进行可视化，并采用Scimago Graphica生成国际合作地理可视化图。
**研究结果**
**5.1 出版物产出概况**：从WoSCC共检索到1246篇合格文献，经筛选后最终纳入979篇，涉及267种期刊、7509位合作作者和33183篇参考文献。2017年至2020年间发表量和被引量急剧上升，之后增速放缓，表明该领域从早期采纳阶段过渡到成熟期。
**5.2 国家/地区与机构分布**：中国在发表数量和被引次数上均居首位（12576次被引），其次为美国（2689次被引）和法国（1073次被引）。国际合作网络显示中国与美国是主要合作伙伴。机构方面，复旦大学发表287篇（占29.3%），其次为中山大学（192篇）和浙江大学（139篇），前十名机构全部来自中国，且形成以复旦大学、中山大学和浙江大学为中心的三个主要合作集群。
**6 作者与共被引作者分析**：范嘉（Fan Jia）以25篇论文成为最多产作者，其次为周建（Zhou Jian，24篇）和高强（Gao Qiang，12篇）。高中心性作者（如范嘉、周建、高强）构成密集合作网络，充当研究枢纽。被引最多的作者为张泽民（3187次被引）、张明奇（3138次被引）和胡雪丹（1217次被引）。基于第一作者共被引分析，Llovet Josep、Ma Lichun和Sung Joseph是最常被共被引的作者。
**7 期刊分析**：《Frontiers in Immunology》发表数量最多（80篇），《Cell》被引次数最高（2174次），其次为《Journal of Hepatology》（2016次）和《Nature》（1495次）。《Journal of Hepatology》、《Nature Communications》和《Frontiers in Immunology》是该领域的核心期刊。《Cell》、《Nature Communications》、《Hepatology》、《Journal of Hepatology》和《Nature》表现出最强的共被引爆发。期刊双图叠加显示主要引用轨迹为“分子、生物学、免疫学”到“分子、生物学、遗传学”，以及“医学、临床”到“健康、护理、医学”，表明知识从基础生物学向临床转化流动。
**7.1 出版物与参考文献引文分析**：该领域出版物共被引18282次，平均每篇18.67次。被引最多的论文是Zheng等（2017）在《Cell》上发表的《Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing》（1558次被引），建立了首个HCC T细胞单细胞转录组图谱。第二是Zhang等（2019）在《Cell》上发表的《Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepatocellular Carcinoma》（1068次被引），揭示了HCC中动态免疫景观。共被引分析显示，42篇高共被引参考文献中，最常被共被引的是2017年《Annu Rev Pathol》上关于癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肝癌中作用的综述，其次是关于CAFs促进胆管癌生长的原创论文（《Cancer Cell》，2021）和SCENIC方法学论文（《Nature Methods》，2017）。这反映了该领域的研究前沿既依赖于对基质成分（如CAFs）的深入探索，也依赖于单细胞数据分析的计算工具。
**7.2 关键词共现分析**：高频关键词包括“肝细胞癌”、“单细胞RNA测序”、“肿瘤微环境”、“T细胞”和“基因表达”。关键词聚类为15个主题组。关键词爆发检测和时间线图显示，研究焦点从最初的基因表达和肿瘤内异质性，过渡到肿瘤微环境表征，当前正转向细胞间通讯、生长因子、细胞外囊泡和基因调控网络等新兴热点，标志着该领域从描述性图谱构建向动态机制研究和转化应用的成熟。
**总结与讨论**
讨论部分指出，scRNA-seq在肝癌研究中的应用已从根本上改变了对该恶性肿瘤的理解。研究呈现以下关键发现：①全球发表量快速增长，中国主导研究产出，美国是主要国际合作者；②作者合作网络高度集中，少数高产作者（如范嘉、周建、高强）充当枢纽；③核心期刊（如《Cell》、《Journal of Hepatology》）和前沿研究（如T细胞图谱、CAFs作用）奠定了该领域的基础；④关键词演化清晰展示了从描述性图谱构建到TME表征，再到动态细胞间通讯和基因调控网络的转化轨迹。讨论还指出了scRNA-seq在肝癌研究中的新治疗靶点和生物标志物发现机遇，包括免疫检查点（如TREM2?巨噬细胞）、CAFs亚型、耐药性亚克隆的转录程序以及细胞类型特异性基因签名。同时，技术挑战（如组织解离伪影、空间背景丢失）、分析挑战（批次效应、高维数据）和临床转化挑战（高成本、缺乏标准化方案）仍需解决。未来方向包括：整合多组学和空间转录组学、开发标准化计算流程、加速候选靶点的功能验证、建立更广泛的国际合作网络。
**研究结论翻译**：本文献计量分析巩固了scRNA-seq在重塑肝癌研究中的非凡历程。从最初作为细胞图谱工具的角色，该领域已迅速发展为一门精细学科，解构动态肿瘤生态系统，揭示癌细胞、免疫成分和基质元素之间的复杂相互作用。中国的主导地位和关键的国际合作凸显了对抗这一疾病所需的全球努力。肝癌研究轨迹已从解析异质性发展到绘制微环境，再到当前破译细胞间通讯，为发现新治疗靶点和生物标志物释放了巨大潜力。这些见解共同为更个性化和更有效的治疗指明了清晰路径。
