QuTILs：用于研究领域的开源图像驱动的浸润性免疫细胞检测技术

《npj Breast Cancer》：QuTILs: open-source image-based infiltrating immune cell detection for research application

　　

摘要

通过肿瘤组织的苏木精和伊红染色组织切片来计数间质瘤浸润淋巴细胞（sTILs），这类细胞与三阴性乳腺癌（TNBC）患者对化疗的更好反应以及更高的总体生存率相关。苏木精和伊红染色切片的数字化为基于图像的计算方法用于计数sTILs提供了可能。我们介绍了QuTILs，这是一种基于研究的TIL计数方法，它利用多层感知器框架，通过QuPath软件在开源的苏木精和伊红染色图像上进行训练，可在普通计算机上运行。QuTILs被应用于两项III期TNBC临床试验——CALGB 40502和40603的苏木精和伊红染色图像中（总共有n?=?462名患者）。在Cox比例风险模型中，QuTILs在CALGB 40502试验中显示出显著的单一变量关联，较高的TIL%水平与较低的风险相关（HR: 0.75，95% CI: 0.63–0.91），这一关联在多变量模型以及验证性的CALGB 40603 TNBC临床试验中依然显著。总之，QuTILs为从数字化的苏木精和伊红染色图像中识别sTILs提供了一种计算效率高、基于开源技术的解决方案，可应用于各类研究。