甲状腺眼病中眼周脂肪组织的整合单细胞转录组与微生物组数据集

《Scientific Data》：An integrated single-cell transcriptomic and microbiome dataset of orbital adipose tissue in thyroid eye disease

　　

摘要

甲状腺眼病（TED），在历史上也被称为甲状腺相关眼病（TAO）或格雷夫斯眼病（GO），是一种自身免疫性眼病，其特征为眼眶脂肪组织出现炎症和脂肪生成。虽然人们已经认识到免疫细胞浸润和成纤维细胞活化在其中的作用，但细胞异质性以及局部微生物失衡在眼眶微环境中的潜在作用仍不明确。在此，我们展示了来自北京同仁医院的患者甲状腺眼病病例及健康对照组的眼眶脂肪组织的多组学数据集。该数据集包含从人类眼眶脂肪组织和皮下脂肪中获取的单细胞RNA测序数据。经过质量控制筛选和双细胞去除后，共有61,302个高质量的单细胞被保留下来用于后续分析，这些数据能够反映眼眶成纤维细胞、免疫细胞亚群以及血管细胞的转录组特征。与此同时，还对研究队列中收集的眼眶脂肪组织样本以及用于污染检测的环境样本进行了16S rRNA基因测序，以确定低生物量的眼眶微生物组的DNA特征。我们提供了原始测序读段、经过质量控制的基因表达矩阵以及经过污染校正的微生物特征表。该数据集为研究宿主细胞免疫与局部微生物组特征之间的相互作用提供了可能，有助于提出关于宿主-微生物组相互作用的假设，并为寻找治疗甲状腺眼病的新靶点提供依据。