量子分子共振与分泌组学的联合治疗可减轻视网膜色素上皮细胞中对氧化应激的嵌合转录本反应

《Scientific Reports》：Combination treatment with quantum molecular resonance and secretome attenuates the chimeric transcript response to oxidative stress in retinal pigment epithelial cells

　　

摘要

嵌合转录本长期以来被视为肿瘤发生的标志，但在环境压力作用下，非肿瘤细胞中也会产生此类转录本，不过在相关模型中对其量化仍不够准确。我们通过对72份生物样本进行有序因子设计研究，分析了视网膜色素上皮（ARPE-19）细胞的嵌合转录组情况，这些样本涵盖了氧化应激、量子分子共振（QMR）疗法、治疗性分泌组及其组合等多种处理条件。通过分层分析流程和深度标准化计数模型，研究发现氧化应激使嵌合转录本的数量增加了33%（发生率比值为1.33，95%置信区间为1.21-1.46，排列检验p值为0.002）。当共同分析嵌合连接点时，疗法能够特异性地逆转由应激引发的嵌合转录本增加现象（应激与疗法的交互作用比值IRR为0.52，95%置信区间为0.32-0.84，p值为0.007），而作为阴性对照的恒定型嵌合转录本则没有出现相应变化（p值为0.49）。此外，氧化应激诱导的嵌合转录本在编码潜力方面并非随机出现：它更倾向于形成能够保持阅读框架、因而可被翻译的嵌合转录本（应激与阅读框架的比值比为2.59，95%置信区间为1.11-6.04，p值为0.028）。在QMR疗法与治疗性分泌组联合使用时，这种效应最为显著（IRR为0.40，q值为0.007）。其中一个名为CTDNEP1-ENSG00000262526的嵌合转录本通过了假发现率控制，并通过其他独立检测方法、RT-qPCR以及桑格测序得到了验证。因此，嵌合转录本的数量是氧化应激的一种可测量、非随机且可通过疗法逆转的表型；不过其生成机制目前尚不明确。