针对NSCLC的新型多表位治疗性疫苗的计算机模拟设计：反向疫苗学策略

《Scientific Reports》：In silico design of a novel therapeutic multi-epitope vaccine against NSCLC: a reverse vaccinology approach

　　

摘要

非小细胞肺癌仍是全球癌症相关死亡的主要原因之一，这凸显出需要有效的免疫治疗策略。本研究致力于设计并评估一种多肽疫苗，该疫苗针对在非小细胞肺癌中频繁过表达的五种关键肿瘤相关抗原（MAGE-A4、NY-ESO-1、MUC1、SURVIVIN和HER2），同时探讨加入钙网蛋白作为免疫刺激佐剂的效果。通过免疫信息学方法，设计了三种不同的疫苗结构：一种含有钙网蛋白佐剂，另一种不含佐剂，第三种则由这些肿瘤相关抗原的完整序列构成。使用NetMHCpan 4.1和NetMHCIIpan 4.1进行表位预测，随后检测其抗原性、致敏性、免疫原性和毒性。将预测得到的新表位通过合适的连接子组装成多肽结构，再分析其物理化学特性以及与TLR和HLA等位基因的结构相互作用。分子对接和动力学模拟显示，含有钙网蛋白的疫苗结构与TLR4之间存在强烈相互作用。利用C-ImmSim平台进行的免疫模拟表明，该疫苗能够强烈激活B细胞和T细胞反应。尽管计算机模拟结果令人乐观，但仍需进一步的体外和体内研究来全面评估该疫苗的安全性和治疗效果。