扇贝肠道微生物群对沉积物特征及人为活动的影响

《Microbial Ecology》：Bivalve Gut Microbiome Responses to Sediment Characteristics and Anthropogenic Activities in Cerastoderma edule (Linnaeus, 1758)

　　

摘要

河口是受环境条件变化及沉积物污染影响的动态生态系统，这些因素可能会影响宿主相关的微生物群。本研究调查了在不同人为压力下的三个河口区域中双壳类动物Cerastoderma edule的肠道微生物群。通过整合细菌16S rRNA和真菌ITS的宏条形码数据以及沉积物的物理化学参数，分析了肠道微生物多样性和组成的空间与季节性变化。不同地点和季节之间，细菌群落存在明显差异，在有机物和痕量金属浓度较高的区域，差异更为显著。真菌群落在不同样本间也有差异，但由于大量ITS分类单元无法被鉴定，其分析受到限制。多元分析表明，肠道微生物组成与沉积物参数之间存在关联，包括有机物、盐度以及汞（Hg）、锌（Zn）和铅（Pb）等痕量金属。利用FAPROTAX工具根据分类数据推断出了细菌的功能特征，表明它们可能参与氮、硫和碳循环以及有机化合物的降解。不过需要指出的是，这些功能预测应被视为潜在代谢能力的指标，而非实际活动的直接证据。总体而言，这些研究结果表明C. edule的肠道微生物群具有很大的潜力，可作为评估河口环境状况及宿主与环境相互作用的辅助工具。