《TRENDS IN Molecular Medicine》：The role of pharmacomicrobiomics in colorectal cancer therapy
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癌症治疗反应的个体间差异是结直肠癌（CRC）管理中的主要挑战。肠道微生物组通过改变抗癌药物的药代动力学和药效动力学，导致治疗疗效和毒性的差异。此外，细菌产物与肿瘤细胞和免疫细胞相互作用，改变治疗结果。本综述聚焦于药物微生物组学（pharmacomicrobio
癌症治疗反应的个体间差异是结直肠癌（CRC）管理中的主要挑战。肠道微生物组通过改变抗癌药物的药代动力学和药效动力学，导致治疗疗效和毒性的差异。此外，细菌产物与肿瘤细胞和免疫细胞相互作用，改变治疗结果。本综述聚焦于药物微生物组学（pharmacomicrobiomics）对CRC治疗的影响。研究人员在机制层面描述了肠道微生物群如何影响药物代谢，并概述了特定微生物及其产物与CRC治疗中使用的化疗、靶向治疗和免疫治疗的相互作用。最后，研究人员概述了当前策略，包括益生菌、工程细菌和粪菌移植，这些策略利用肠道微生物组来提高治疗疗效并降低毒性。
Pharmacomicrobiomics shapes drug response in colorectal cancer
癌症治疗反应的个体间差异是结直肠癌临床管理的主要挑战。接受相同治疗的患者可能呈现持久应答、内在耐药或严重剂量限制性毒性等截然不同的结局。尽管分子分层显著推进了精准肿瘤学，但以肿瘤为中心的基因组和转录组信号仅能部分预测治疗反应或毒性，因此研究焦点日益转向肿瘤外在因素，其中肠道微生物组已成为抗癌治疗的关键调节因子。肠道微生物组包含细菌、古菌、真菌和病毒，而细菌是最丰富且特征最明确的组分。本综述主要聚焦细菌的贡献，涵盖与药物在肠道环境内相互作用的管腔细菌以及可直接浸润癌细胞并改变治疗反应的肿瘤驻留细菌。结直肠癌具有独特性：肿瘤与肠道微生物直接相邻，特定菌种如具核梭杆菌（Fusobacterium nucleatum, Fn）在肿瘤组织中富集，且多种标准治疗方案经口服或肠肝循环反复暴露于肠道环境，从而增加微生物介导调节的机会。
Mechanistic basis of pharmacomicrobiomics in CRC
肠道微生物组及肿瘤驻留细菌可通过四种关键途径影响药物暴露、疗效和毒性：（i）直接微生物药物生物转化；（ii）调节宿主药物代谢酶；（iii）改变决定药物效应的瘤内信号通路；（iv）重塑肿瘤-免疫相互作用。
Direct microbial drug biotransformation in CRC
最直接的机制是细菌酶对药物进行化学修饰。由preTA操纵子编码的细菌嘧啶还原酶具有二氢嘧啶脱氢酶（DPD）样活性，在肠腔中将5-氟尿嘧啶（5-FU）还原为二氢-5-FU，降低药物生物利用度；然而，瘤内细菌如弗氏柠檬酸杆菌（Citrobacter freundii）通过preTA介导的局部灭活可驱动化疗耐药。临床证据显示，肠道preTA丰度与5-FU诱导的毒性负相关，提示管腔代谢可减轻全身毒性，而瘤内活性则可损害疗效。水解反应同样重要，细菌β-葡萄糖醛
