土壤病毒对盐胁迫的适应:基因组大小扩展与功能多样化的见解

《Environmental Microbiology》:Adaptation of Soil Viruses to Salinity Stress: Insights Into Genome Size Expansion and Functional Diversification

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年08月19日 来源:Environmental Microbiology 4.0

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   摘要 病毒是土壤生物多样性和生态系统功能的重要组成部分。然而,它们对土壤盐胁迫的响应,包括生态模式和功能潜力,仍然知之甚少。在此,从公共数据库中检索了 84 个盐渍土样本的宏基因组数据并进行了分析。从宏

  

摘要

病毒是土壤生物多样性和生态系统功能的重要组成部分。然而,它们对土壤盐胁迫的响应,包括生态模式和功能潜力,仍然知之甚少。在此,从公共数据库中检索了 84 个盐渍土样本的宏基因组数据并进行了分析。从宏基因组中提取病毒序列,并鉴定了辅助代谢基因(AMGs)。83.34% 的 vOTUs 与 RefSeq 病毒数据库没有可检测到的基因共享联系,突出了盐渍土病毒组未被探索的多样性。在盐度较高的土壤中,病毒基因组表现出更大的基因组大小和增加的 GC 含量。温和病毒(3.16–7.32)的多样性显著高于裂解病毒(2.49–6.99)。尽管温和病毒的多样性随盐度增加而降低,但裂解病毒未观察到显著趋势。病毒丰度与宿主丰度呈正相关,这与“乘胜追击”生态耦合假说一致。功能潜力随盐度变化,结构分析显示关键蛋白(NhaA,ACAT)在不同盐度梯度下的原子相互作用发生变化。发现病毒多样性与耐盐性、碳固定、有机磷矿化和氮代谢相关的功能潜力之间存在显著的正相关。这些结果表明病毒特征与盐度梯度相关,并为了解病毒在盐渍土中的响应提供了见解。

图文摘要

土壤病毒对盐度变化的响应。此信息图说明了土壤病毒群落如何通过增加基因组大小和 GC 含量来适应土壤盐度的增加。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

本研究使用的主要数据来源于 NCBI BioProject 数据库中公开可用的数据集 PRJNA1018220,额外的支持数据来自 PRJNA700090 (NCBI BioProject)、PRJNA1031080 (欧洲核苷酸数据库—ENA) 和 CRA003771 (中国科学院国家生物信息中心/北京基因组研究所基因组序列存档)。所有数据均可公开访问,可使用提供的登录号从其各自的存储库中检索。

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