环境适应过程中八放珊瑚的微生物组灵活性与代谢组缓冲

《Microbial Ecology》：Microbiome Flexibility and Metabolomic Buffering in Octocorals During Environmental Acclimation

　　

摘要

八放珊瑚是珊瑚礁的关键物种，也是珍贵生物活性化合物的来源，然而其驯化培养背后的微生物动态仍知之甚少。我们考察了移植珊瑚在细菌群落和代谢组之间是否显示出不同的恢复轨迹，并探索了微生物功能冗余在塑造全生物体韧性方面的潜在作用。为此，我们分析了移植八放珊瑚Lobophytum sp. 和Sclerophytum sp. 的 19 周多组学时间序列数据集（16S rRNA 测序、氨基酸和脂质谱分析），并以野生珊瑚礁基线为基准。细菌群落最初分化，在第 12 周趋同，并在第 19 周再次分化，而代谢组尽管存在物种特异性差异，但始终趋同于野生常态。微生物和代谢组数据的整合进一步揭示，微生物 - 代谢物关联在不同环境中被重构，这与环境驱动的全生物体相互作用重组相一致。这些发现表征了八放珊瑚细菌群落适应期间的时间动态，并将代谢组稳定性确定为全生物体韧性的互补指标，对监测和优化八放珊瑚培养具有意义。