由平脐菇引起的指形粟脚腐病人工接种技术的标准化及其基于 qPCR 的病原体定量验证

《Journal of Plant Pathology》：Standardization of artificial inoculation technique for foot rot of finger millet caused by Sclerotium rolfsii and its validation using qPCR-based pathogen quantification

　　

摘要

由Sclerotium rolfsii Sacc. 引起的脚腐病或枯萎病已成为印度南部指状高粱（Eleusine coracana L. Gaertn.）生产的主要制约因素。可靠的人工接种方法对于致病性研究和抗性筛选至关重要，然而，针对指状高粱-S. rolfsii 病原系统的标准化方案仍然缺乏。本研究旨在开发、优化和验证人工接种技术（AITs），以便在受控条件下可重复地诱导病害。对卡纳塔克邦南部 60 个地点的广泛田间调查发现，脚腐病的发生率存在相当大的空间差异，曼迪亚县记录到的平均病害发生率最高（42.24%）。获得了 15 个S. rolfsii 分离物，通过培养特征和基于 ITS 的分子鉴定进行了确认。基于 ITS 序列数据的系统发育分析将S. rolfsii 分离物分为三个亚群。在温室条件下评估了总共九种 AITs 和一个对照组，其中在领部使用牙签插入法被证明是最有效且可重复的，因为它产生了最早的症状发育（10–12 天）、最高的病害发生率（100%）、最大的病斑长度和最大的病害进展曲线下面积（AUDPC）。靶向 ITS 区域的 qPCR 证实，与其他接种技术相比，使用牙签和木夹方法接种的植物中病原体定殖更高。这些优化的接种方法进一步用于评估四个指状高粱基因型，并揭示了不同的寄主反应，其中 KMR-204 基因型在两种有效的接种方法下均表现出抗性。标准化的基于牙签的接种系统为在抗性基因型筛选和进行指状高粱-S. rolfsii 病原系统致病性测定中诱导脚腐病提供了一种可靠、快速且可重复的方法。