暴露于嗜神经病毒的人 iPSC 衍生神经元蛋白质组资源

《Scientific Data》：A Proteomic Resource of Human iPSC-derived Neurons Exposed to Neurotropic Viruses

　　

摘要

病毒感染在人类整个生命周期中都很普遍，但它们在人类神经元上的分子效应仍知之甚少。我们展示了一个基于质谱（MS）的蛋白质组学数据集，该数据集对暴露于五种嗜神经病毒后的人类诱导多能干细胞（iPSC）来源神经元进行了分析：单纯疱疹病毒 1 型（HSV-1）、人类冠状病毒 229E（HCoV-229E）、爱泼斯坦 - 巴尔病毒（EBV）、水痘 - 带状疱疹病毒（VZV）和甲型流感病毒（H1N1）。从 KOLF2.1 J iPSC 细胞系分化而来的神经元在多种病毒剂量下进行感染，并在三个感染后时间点进行取样。使用数据非依赖性采集质谱和定制的人 - 病毒蛋白质组库对蛋白质丰度进行定量，从而能够同时检测宿主和病毒蛋白。该数据集包含约 7,500 种人类蛋白和病毒特异性肽段，提供了一个系统控制的资源，用于比较病毒依赖性和时间依赖性的蛋白质组学反应。所有原始 MS 文件和处理后的数据均已公开存入 PRIDE 数据库，并且有一个交互式网页应用程序支持数据探索和重用。该数据集旨在支持跨病毒比较、假设生成以及与转录组学和人群规模数据集的整合。