中国京津冀地区风景区中库蠓（Culicoides）叮咬媒介病毒组的转录组学研究

《Microbial Ecology》：Metatranscriptomic Survey of the Virome of Culicoides Biting Midges in Scenic Areas of the Beijing-Tianjin-Hebei Region, China

　　

摘要

叮咬蝇是重要的医学和兽医传播媒介昆虫，能够传播多种人畜共患病毒。北京-天津-河北（BTH）地区作为中国的核心区域，拥有丰富的旅游资源，但该地区叮咬蝇的病毒组特征仍不清楚。共收集了12,152只叮咬蝇，鉴定出7种Culicoides属昆虫。Culicoides punctatus（67.02%）和Culicoides morisitai（19.01%）是主要物种。所有样本根据采样地点和蚊虫种类进行分组，共构建了49个样本池。每个样本池包含50只蚊虫作为标准，数量少于50只的样本被排除在分析之外。每个样本池仅包含来自同一采样地点的同种雌性蚊虫。通过宏转录组测序获得了45,369个初步的类病毒序列片段。经过开放阅读框（ORF）预测、序列聚类和后续注释后，得到了208个可用于后续病毒组分析的预测病毒序列。病毒组分析显示，RNA病毒在病毒组中占主导地位，其中正链单链RNA（(+)-ssRNA）病毒是最丰富的类别。地理位置和宿主种类显著影响了病毒群落的组成（PERMANOVA，P < 0.05）。基于整理后的序列进行的系统发育分析确定了22种病毒，包括4种已知病毒和18种推测的新病毒谱系。本研究首次系统地揭示了BTH地区Culicoides病毒组的多样性特征，并发现了多种推测的新病毒谱系，为该地区虫媒病毒的监测和预防提供了重要的科学依据。研究结果强调了Culicoides作为病毒宿主的生态重要性，表明需要加强对该地区媒介传播病毒的持续监测。