基于高分辨率真实彩色切片图像的恒河猴大脑交互式2D/3D解剖学资源

《Scientific Reports》：An interactive 2D/3D anatomical resource of the rhesus monkey cerebrum from high-resolution real-color sectioned images

　　

摘要

恒河猴的大脑是进行比较神经科学和转化神经科学研究的重要解剖模型，但直接获取高质量脑样本的途径十分有限。现有的基于磁共振成像（MRI）的图谱虽然提供了宝贵的空间参考信息，却无法保留原始样本的真实颜色组织形态。在“Visible Monkey”项目的基础上，本研究利用高分辨率的彩色切片图像建立了恒河猴大脑的集成解剖资源。研究使用了77张头部连续切片图像，对35个主要脑结构进行了手动分割。分割过程中参考了INIA19图谱、猕猴哈佛-牛津图谱（mHOA）以及恒河猴头部的彩色切片图像图谱，但并未直接移植图谱中的标签。分割后的结构被重建为实色三维（3D）表面模型，并测量了其体积。各脑区的体积分布与mHOA的结果大体一致，证实了这些解剖结构的合理性。该数据集被整合到一个交互式网络应用程序中，该应用程序结合了切片图像、分割结果、切片位置指导和3D模型。这一资源为反复进行解剖学研究提供了实用的平台，并通过将图谱引导的分割结果与彩色切片解剖结构及交互式3D可视化结合在一起，补充了基于MRI的图谱的不足。