通过以网络为中心的方法识别CXCR2，解读肝细胞癌中的肿瘤-免疫相互作用

《International Journal of Molecular Sciences》：Decoding Tumor–Immune Interactions in Hepatocellular Carcinoma Through Network-Centered Identification of CXCR2

　　

摘要

肝细胞癌（HCC）是全球最常见的癌症之一，在分子和临床特征上表现出显著的生物学异质性。HCC的多种分子改变和临床表现表明患者亚群之间存在很大的异质性。本研究旨在利用整合生物信息学方法识别与HCC相关的新治疗靶点和预测生物标志物。从UCSC Xena浏览器中获取高通量基因组数据集，以检索TCGA-HCC队列中的mRNA HTSeq计数数据。通过基因共表达网络（GCN）、蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPIN）和富集分析，识别出关键的失调基因及其生物学意义。整合网络分析确定了三个失调的枢纽基因：CXCR2、TLR2和TLR4。进一步评估了这些基因在TCGA-HCC队列中的肿瘤样本中的基因组改变。Kaplan–Meier（KM）生存分析显示，较低的CXCR2 mRNA表达与较差的总生存率（OS）和无复发生存率（RFS）显著相关。此外，TIMER和UALCAN分析揭示了CXCR2表达与肿瘤纯度以及免疫细胞浸润水平（包括T细胞、巨噬细胞、树突状细胞（DCs）和中性粒细胞）之间的显著关联。这些发现表明，CXCR2与HCC的免疫微环境密切相关，并且作为一个潜在的预后生物标志物，其生物学作用值得进一步机制研究。