黄尾鰤（Seriola lalandi）的群体遗传学证实半球分化并揭示温带北太平洋及野生与人工养殖鱼类之间的遗传结构

《Ecology and Evolution》：Population Genetics of Seriola lalandi Confirm Hemispheric Divergence and Reveal Genetic Structure in the Temperate Northern Pacific and Between Wild and Captive-Reared Fish

　　

黄尾鰤（Seriola lalandi）是一种广泛分布的海洋物种，对渔业和水产养殖均具有很高的商业价值。尽管S. lalandi的分类学地位尚未解决，本研究考察了其在两个太平洋区域的群体遗传结构，并评估了野生与人工养殖鱼之间的遗传分化。在全球范围内，研究结果显示S. lalandi存在两个遗传分化类群：一个局限于温带北太平洋（墨西哥-美国），另一个分布于温带南美洲（智利），二者具有显著分化（遗传分化指数F_ST = 0.208）。在野生群体中，北半球个体较南半球（智利）个体表现出更高的杂合度。研究人员还检测到北太平洋内部的精细尺度群体亚结构（F_ST = 0.078），以及智利（F_ST = 0.049）和墨西哥（F_ST = 0.120）野生鱼与人工养殖群体之间一致性的遗传分化。综上，这些发现支持S. lalandi存在两个独立演化谱系的假说，并对目前认为温带北太平洋存在单一北方群体（即Seriola dorsalis）的观点提出质疑，强调需要针对区域特异的渔业和水产养殖管理策略。

## 研究背景与目的

黄尾鰤（Seriola lalandi）是广泛分布的高经济价值海洋鱼类，在商业捕捞和水产养殖中地位重要。该研究发表于《Ecology and Evolution》。目前，S. lalandi在不同区域和全球尺度上的群体结构仍存在争议，尤其是温带北太平洋的群体划分尚不清楚；同时，野生群体与人工养殖群体之间的遗传比较研究有限。随着水产养殖中苗种跨区域甚至跨半球运输日益普遍，养殖逃逸可能对本地野生群体造成遗传影响。为此，研究人员基于497个野生与人工养殖个体，评估S. lalandi的遗传多样性和群体结构，并分析若干第一代人工养殖群体（F₁）与野生群体的遗传相似性，以判断非故意养殖逃逸的潜在影响。

## 关键技术方法

研究人员采用多站点采样，自墨西哥、智利、美国等地获得野生与人工养殖F₁群体，并合并此前已发表的部分数据集，最终分析497个个体。利用9个微卫星位点进行PCR扩增和基因分型，剔除无效等位基因和高相关个体后保留8个位点；使用MICRO-CHECKER、ML-Null、ML-RELATE进行基因型质量控制与亲缘关系过滤；用BayeScan检测异常位点；计算遗传多样性指标和近交系数（F_IS）；采用成对F_ST、Jost's D、分子方差分析（AMOVA）、主成分判别分析（DAPC）、UPGMA聚类和层次STRUCTURE分析群体结构，用Mantel检验距离隔离，并用divMigrate估计相对迁移方向。

## 研究结果

### 3.1 野生群体与人工养殖Seriola lalandi群体的遗传多样性

为减少Wahlund效应，研究人员剔除了96个疑似全同胞个体，并进一步剔除56个存在多个无效等位基因的基因型及Sdu21位点，最终保留497个个体。8个微卫星位点在12个采样群体中均具有多态性。墨西哥哥野生群体的观测杂合度（H_O = 0.733）和期望杂合度（H_E = 0.787）均高于智利群体（H_O = 0.645，H_E = 0.715）。胡安·费尔南德斯（JF