摘要
背景/目标： 大豆初荚形成高度（FPIH）是植物生长过程中的一个关键性状，但其在欧亚种质的遗传结构仍未被充分了解。方法： 我们使用了180个欧亚品种（SoySNP50K芯片，包含约400万个SNP）在俄罗斯四个不同环境中（2021–2022年）进行全基因组关联分析（GWAS）和精细定位研究，采用了两种模型：基于残差的模型和考虑额外变量的模型。SuSiE精细定位技术被用来进一步确定候选基因位点。结果： 考虑额外变量的模型在控制基因组膨胀（λ = 1.08 vs 1.16）和SNP遗传率方面表现更好（0.381 vs 0.014）；基于残差的模型遗传率较低是在预期之中的，因为该模型去除了环境主效应及其相关的遗传变异。因此，这两种模型是互补的：前者捕捉稳定的遗传效应，后者突出环境依赖的信号。SuSiE技术精确定了三个基因位点。在13号染色体上，靠近MYB83和BEN1的两个独立信号（Gm13_30553403, Gm13_30909346；PIP ≥ 0.99）在两种模型中均得到验证。在4号染色体上，信号转移到了靠近COBL4/IRX6的Gm04_36933515位点（PIP = 0.9999），但模型之间的依赖性存在，目前不建议将此位点用于标记开发。在5号染色体上，最初的GWAS候选SNP并非真正的原因基因；两个紧密连锁的SNP（Gm05_38427309和Gm05_38710046，r2 = 0.714，PIP ≥ 0.99）形成了一个位于
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