《ACS Omega》:Size Selective Recognition of G-Series Nerve Agents via Aryl–C–H Interactions with the Supramolecular Pinwheel and Tetracene-Based Host: A Computational Study
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有机磷神经毒剂通过不可逆抑制乙酰胆碱酯酶(AChE)干扰中枢与外周神经系统神经传递,因而快速可靠识别此类毒剂对及时检测与缓解至关重要。研究人员采用M06-2X-D3/6-31+G(d)水平的密度泛函理论(DFT)考察了超分子风车主体与模型化并四苯(tetrac
有机磷神经毒剂通过不可逆抑制乙酰胆碱酯酶(AChE)干扰中枢与外周神经系统神经传递,因而快速可靠识别此类毒剂对及时检测与缓解至关重要。研究人员采用M06-2X-D3/6-31+G(d)水平的密度泛函理论(DFT)考察了超分子风车主体与模型化并四苯(tetracene)基主体对G系列神经毒剂客体的尺寸选择性主客体相互作用。计算结果表明,G系列毒剂塔崩(Tabun, GA)与超分子风车主体封装时亲和力强且选择性最高;索曼(Soman, GD)与环沙林(Cyclosarin, GF)则有效封装于富电子并四苯基主体空腔中,结合能高于同系物。所有主客体复合物在热力学上均有利。稳定化源于多重非共价相互作用,包括C–H···F、C–H···O氢键、C–H···π相互作用与范德华力,以及主客体结构互补性。非共价相互作用经分子静电势(MESP)表面形貌、分子中原子(AIM)分析及约化密度梯度(RDG)法表征,能量分解分析进一步阐明了封装复合物稳定性的相互作用本质与贡献。
研究背景方面,有机磷(OP)神经毒剂(CWNAs)通过丝氨酸残基与毒剂磷原子形成不可逆共价键抑制乙酰胆碱酯酶(AChE),导致神经递质乙酰胆碱(ACh)蓄积、突触过度刺激,引发呼吸衰竭甚至死亡。现有检测手段中仪器法成本高,共价传感法易因成键产生假阳性,而基于非共价相互作用的超分子识别具有可逆、低假阳性优势。G系列毒剂(塔崩GA、索曼GD、沙林GB、环沙林GF)具各向异性几何与极性–P═O官能团,亟需方向性非共价识别策略。该文发表于《ACS Omega》,研究人员针对实验报道的风车主体空腔过大问题,理性缩小纳米环尺寸设计6CPP_1R、7CPP_1R等改性主体,并模型化并四苯基主体TET_6R2、TET_7R2,系统计算其与G系列毒剂的主客体封装。
关键技术方法上,研究人员从CCDC(2334370)获取氟化风车晶体结构,去氟加氢并缩减苯环数得计算模型;所有体系经MMFF力场构象搜索取最低能构象,于M06-2X-D3/6-31+G(d)水平全优化,6-311++G(d,p)单点校正,PCM(二氯甲烷ε=8.39)考溶剂效应,BSSE用计数法校正;结合能ΔE、自由能ΔG由频率计算获RRHO近似;平衡常数Ka由ΔG算得;MESP用Multiwfn绘表面;AIM与RDG用Multiwfn分析键临界点;SAPT0/def2-SVP(PSI4)作能量分解;TD-DFT(50单重态)算吸收/发射光谱。样本为计算模型分子,无实验队列。
结果与讨论部分保留小标题叙述如下。引言指出OP毒剂分类及超分子纳米环(如cycloparaphenylene, CPP)因形状互补可封装GA,本文延伸用风车与并四苯基主体。计算方法论已前述。结果讨论中,MESP表面显示主体空腔负电势、毒剂氧(GA另含–CN)负电势,驱动定向封装。结合能计算表明7CPP_1R(腔体665.9 ?3)优于6CPP_1R(582.8 ?3),对GA/GD/GF/GB的ΔE为–26.4/–22.6/–21.6/–19.8 kcal/mol,ΔG顺序GA>GD>GF>GB,GA的Ka气相达4.7×106 M–1,DCM中仍比GD高三个量级,显示对GA强尺寸选择性。AIM给出键临界点(3,–1)拓扑参数,RDG散点中(sign λ2)ρ<0为氢键、≈0为范德华、>0为排斥,证实C–H···π与色散主导稳定。TD-DFT显示7CPP_1R宿主λmax 291.9 nm,包GA后红移298.6 nm且发光淬灭,其他毒剂位移小,GA具诊断光谱签名。扩展至7CPP_2R、7CPP_3R时仅GA作客体,结合自由能仍最高。并四苯基主体对GD、GF结合能高于同系物。SAPT0分解显示静电、诱导、色散均为稳定负贡献,色散占比可观。
讨论与结论翻译总结:研究人员得出结论,风车主体经尺寸匹配对塔崩(GA)展现最强亲和力与选择性,源于线性乙基片段的C–H···π与周边C–H···O/F/N氢键协同;并四苯基富电子空腔更适配索曼(GD)与环沙林(GF)体积,结合能胜出同系物;所有复合物ΔG<0热力学自发。非共价相互作用图谱(MESP/AIM/RDG/SAPT0)一致指向闭壳层弱相互作用为主。TD-DFT紫外可见与发射红移及淬灭为GA选择性光学读出提供依据。该计算工作为后续实验合成6–7苯环风车及并四苯双环主体、发展可逆低假阳性G系列毒剂传感材料提供了空腔尺寸—几何互补—相互作用类型三位一体的设计原则。