《Veterinary Research Communications》:African tick-borne viruses: A systematic review of diversity, epidemiology, clinical impact, and one health strategies
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背景:蜱传病毒(tick-borne viruses, TBVs)是影响人类和动物健康的新兴病原体,然而其在非洲的多样性、流行病学和临床影响尚未得到系统性的综合阐述。本系统综述旨在描绘TBVs的多样性,量化其感染率和血清阳性率,评估临床结局,并评估非洲监测研究
背景:蜱传病毒(tick-borne viruses, TBVs)是影响人类和动物健康的新兴病原体,然而其在非洲的多样性、流行病学和临床影响尚未得到系统性的综合阐述。本系统综述旨在描绘TBVs的多样性,量化其感染率和血清阳性率,评估临床结局,并评估非洲监测研究中同一健康(One Health)策略的实施程度。方法:研究人员检索了PubMed、Embase、Scopus、Web of Science、CAB Abstracts、African Index Medicus及截至2026年4月9日的灰色文献。独立评审员筛选记录、提取数据,并使用乔安娜·布里格斯研究所(Joanna Briggs Institute)横断面研究工具评估偏倚风险。采用GRADE系统评估证据确定性。异质性通过I2、Cochran's Q和τ2进行量化。结果:共纳入来自35个非洲国家的46项研究(45项横断面研究,1项方法开发研究)。克里米亚-刚果出血热病毒(Crimean-Congo haemorrhagic fever virus, CCHFV)是最常报告的病毒(22项研究),其次是非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV;5项研究)和蜱传脑炎病毒(tick-borne encephalitis virus, TBEV;3项研究)。还鉴定出新型病毒(Kinna、Bogoria、Perkerra、Ntepes、Shibuyunji、Zaloxo)。蜱匀浆是主要样本类型(62.9%)。CCHFV在蜱中的最低感染率范围为0.13%至11.3%,而家畜血清阳性率高达98.2%(牛)和89.4%(骆驼)。高危人群的CCHFV血清阳性率介于1.9%至11.8%之间,Kinna病毒在牧民中的血清阳性率为38.6%。仅三项研究(6.5%)明确采用了同一健康框架。71.7%的研究存在高偏倚风险。CCHFV(I2 = 99.9%)、ASFV(I2 = 99.4%)和JMTV(I2 = 97.2%)的异质性显著。由于严重的偏倚、不一致性、间接性和不精确性,大多数病毒的GRADE确定性极低。结论:基于现有证据,CCHFV在非洲似乎广泛分布,尽管该证据的确定性极低,尤其是在家畜高暴露的情况下。总体证据确定性为极低至低。然而,71.7%的研究存在高偏倚风险,且大多数病毒的GRADE确定性极低,表明研究结果应被视为产生假说而非确定性结论。新型蜱相关病毒的检出日益增多,但综合性的同一健康监测仍然罕见。未来研究应采用基于概率的抽样、确认性诊断和多部门协作方法,以提高证据质量并为控制策略提供信息。
一、方法
该部分详细描述了系统综述的标准化流程。检索策略遵循PRISMA-S报告标准,覆盖PubMed、Embase、Scopus、Web of Science、CAB Abstracts、African Index Medicus等主要数据库及灰色文献,检索时限截至2026年4月9日。纳入标准明确针对非洲背景下与蜱类相关的病毒,限定发表窗口为2014年1月1日至2026年4月9日,纳入对象包括人类、脊椎动物宿主和蜱类。排除标准排除了无现场相关性的纯体外研究、缺乏主要病毒结局的研究以及叙述性综述。数据提取阶段仅当研究报告了蜱类分类学鉴定与同种蜱类中病毒检出的对应关系时,才记录蜱-病毒关联,并提取样本制备和诊断方法信息。偏倚风险评估采用设计特异性工具,如JBI检查表、QUADAS-2、RoB 2等。数据综合涵盖四个组成部分:多样性与生态学图谱、流行病学综合、临床影响综合和同一健康策略综合。统计异质性通过Cochran's Q、I2和τ2评估,并使用GRADE框架评估证据确定性。
二、结果
文献检索与筛选结果:系统检索共获得8,037条记录,去除375条重复后,对7,662条独特记录进行标题和摘要筛选,排除7,460条,最终纳入46项研究。
研究特征与地理分布:纳入的46项研究发表于2014年至2026年,覆盖35个非洲国家。东非贡献16项研究,西非14项,北非10项,中非4项,南非3项。肯尼亚贡献5项研究,突尼斯、加纳、尼日利亚和赞比亚各4项。约72%的研究在2020年后发表,2022年达到峰值9项。45项为横断面研究,1项为方法开发研究。
检出的病毒:共有13种病毒符合严格的蜱传病毒分类标准。CCHFV在22项研究中被报告,ASFV在5项中,TBEV在3项中,Dugbe正内罗病毒在2项中。CCHFV在拥有可提取病毒国家数据的17个国家中的15个被记录,涵盖所有五个非洲次区域。Jingmen蜱病毒在肯尼亚一项研究中池阳性率达45.8%,Kinna病毒在一个暴露人群中的血清阳性率为38.6%。
蜱媒与样本类型:蜱病毒关联最常源自全蜱匀浆或混合蜱匀浆。在物种层面,Hyalomma rufipes和Hyalomma truncatum是研究最多的媒介(各13项研究),其次是Amblyomma variegatum(12项研究)、Hyalomma dromedarii(7项研究)和Rhipicephalus evertsi evertsi(7项研究)。Hyalomma属主要与CCHFV相关,Rhipicephalus属携带内罗病毒和白蛉病毒,Amblyomma属对新病毒发现至关重要。蜱匀浆是最常见的样本类型,占所有采集物的62.9%,血液/血清占30.6%。
诊断方法:ELISA是最常用的方法(14项研究),其次是RT-qPCR(11项)、常规RT-PCR(11项)和二代测序(NGS;9项)。分子技术(PCR和测序)是病毒检测和发现的核心,而血清学检测主要用于人类和家畜的血清阳性率调查。31项研究进行了测序,但病毒分离很少被尝试。
关键定量发现:蜱感染率普遍较低,CCHFV最低感染率范围为0.13%(塞内加尔)至11.3%(毛里塔尼亚)。家畜血清阳性率差异显著:喀麦隆牛CCHFV血清阳性率达98.2%,南非74.2%,尼日利亚71.9%;尼日利亚和毛里塔尼亚的骆驼达89.4%。高危人群的CCHFV血清阳性率介于1.9%至11.8%之间。
统计异质性:CCHFV(I2 = 99.9%)、ASFV(I2 = 99.4%)和JMTV(I2 = 97.2%)均表现出显著异质性,TBEV(I2 = 0.0%)无可检测异质性,但统计效力有限。极端异质性使得汇总患病率不恰当,因此采用叙述性综合。
偏倚风险与证据确定性:46项研究中,33项(71.7%)被归类为高偏倚风险,11项(23.9%)为低风险,2项(4.3%)为中等风险。最常见的偏倚来源包括便利抽样(81%)、缺乏明确纳入标准(76%)、未能处理混杂因素(67%)和缺乏确认性诊断方法(44%)。GRADE评估显示,CCHFV、JMTV、TBEV、Dugbe正内罗病毒和Shibuyunji病毒的证据确定性为极低,ASFV和LSDV为低。
同一健康与监测整合:仅3项研究(6.5%)明确采用同一健康框架,另有10项研究(21.7%)整合了至少两个监测组成部分。媒介监测较为完善,人类监测仅限于10项研究,全面的环境监测缺失。
三、讨论
CCHFV的全球相关性、主要媒介和暴露指标:CCHF是一种广泛分布的蜱传病毒性疾病,死亡率高,无广泛可用的疫苗。CCHFV是非洲各次区域最常检出的病毒。Hyalomma蜱被反复确认为CCHFV的主要媒介。血清阳性率研究显示家畜和人类存在可检测的CCHFV暴露,如尼日利亚骆驼血清阳性率达89.4%,喀麦隆牛达98.2%,但蜱池PCR阳性率显著较低,表明过去暴露与当前感染压力可能存在差异。
共检出、病原体多样性与更广泛的蜱病毒组:多项研究报告了CCHFV与Dugbe正内罗病毒、副粘病毒、Jingmen蜱病毒和Kinna病毒的共检出。共检出本身不能证明病毒重配、直接病毒相互作用或媒介能力改变,需要基因组确认、实验研究和纵向监测。Jingmen蜱病毒和Kinna病毒的检出表明非洲蜱相关病毒多样性不断扩展,但应谨慎解读。
非洲检出的其他蜱传和动物相关病毒:ASFV核酸在南非多种Ornithodoros软蜱池和乌干达高比例猪血清中被检出,证实了野生环境维持和溢出风险。白蛉病毒和Dugbe病毒的低感染率表明这些病原体低水平循环,但仍是发热性疾病的潜在病因。
生态和区域驱动因素:气候、蜱分布、畜牧业实践和跨境动物流动塑造CCHF风险格局。CCHFV在所有五个非洲次区域均有记录,萨赫勒和东非牧区系统骆驼和牛的高血清阳性率与游牧和牲畜贸易在病毒传播中的作用一致。
监测和公共卫生建议:应通过连接人类发热疾病监测、家畜血清学和蜱监测来加强同一健康监测。未来的监测应受益于协调的数据共享、标准化诊断以及人类、动物、媒介和环境数据的整合。
局限性与偏倚风险:非概率抽样、异质性宿主和结局、不一致的诊断方法及有限的确认性检测限制了证据基础。血清阳性表明既往暴露,而PCR检测采样时地点的病毒核酸,两者不可直接比较。全蜱或混合蜱匀浆中的检出证实标本中存在病毒物质,但不能确立复制、媒介能力、传播或临床相关性。
证据确定性与未来研究方向:大多数结局的确定性为低至极低。未来研究应采用基于概率的抽样、确认性诊断、宿主-蜱-池-靶标的一致报告以及综合的人类、动物、媒介和环境监测。
四、结论
本系统综述表明CCHFV是非洲最常报告的蜱传病毒,且已检出多种额外的蜱传和蜱相关病毒。由于大多数证据的确定性为低或极低,结果不应被解释为疾病负担或传播的确定性估计。区域协调、实验室能力、基于概率的抽样、确认性诊断和综合性的同一健康监测将加强未来的风险评估和控制规划。