综述:肠道微生物群膳食多糖利用的结构逻辑

《TRENDS IN FOOD SCIENCE & TECHNOLOGY》:Structural logic of dietary polysaccharide utilization in the gut microbiota

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年08月27日 来源:TRENDS IN FOOD SCIENCE & TECHNOLOGY 17.4

编辑推荐:

   摘要背景膳食多糖是主要的可发酵碳源,其结构多样性引发不同的微生物降解策略和群落层面的代谢响应。尽管在糖分析学和微生物基因组学领域取得了进展,但证据在不同底物和模型系统之间仍然不均衡,限制了对多糖解构、跨谱系协作以及宿主效应的整合性理解。范围与方法本综述采用五阶段机制框架综合当

  

摘要

背景

膳食多糖是主要的可发酵碳源,其结构多样性引发不同的微生物降解策略和群落层面的代谢响应。尽管在糖分析学和微生物基因组学领域取得了进展,但证据在不同底物和模型系统之间仍然不均衡,限制了对多糖解构、跨谱系协作以及宿主效应的整合性理解。

范围与方法

本综述采用五阶段机制框架综合当前证据,将多糖结构与微生物利用联系起来:底物识别与感知、初始裂解、寡糖转运、周质或胞质内次级解聚与去修饰,以及单糖分解代谢与产物形成。该综述比较了主要肠道细菌门和多种底物类别(包括植物贮藏多糖、植物细胞壁多糖、真菌多糖、海洋多糖、动物来源多糖、糖蛋白相关多糖和食品添加剂多糖)中的这些过程,并考虑了底物响应型工程微生物疗法。

主要发现与结论

(1) 在拟杆菌门中,底物特异性由定制化的碳水化合物活性酶库和识别-转运系统编码,塑造了生态位。(2) 多糖可以通过底物可用性、发酵中间产物和交叉喂养来重构微生物群落,但这些响应的方向和幅度取决于底物结构、群落组成和发酵环境。(3) 微生物代谢物将多糖结构与上皮完整性、免疫平衡和代谢稳态联系起来。(4) 嵌入多糖利用位点(PULs)中的天然多糖感知模块为饮食可控的工程微生物提供了基础。总体而言,五阶段框架将多糖结构、微生物利用、群落代谢和干预设计联系起来,支持合理的功能性多糖开发及饮食引导的菌群调节。

引言

人类肠道菌群由庞大且功能多样的微生物群落组成。其细菌成分以杆菌门(原厚壁菌门)和拟杆菌门(原拟杆菌门)的成员为主,同时常见放线菌门(原放线菌门)和变形菌门(原变形菌门)成员(Lynch & Pedersen, 2016; Oren, 2024; Oren & Garrity, 2021)。该群落参与免疫发育、营养吸收、代谢调节以及异源生物转化,包括药物代谢(Koppel et al., 2017; Lynch & Pedersen, 2016)。在塑造该生态系统的各种环境因素中,饮食是持续且可调节的最重要因素之一。膳食多糖及其他复杂糖苷创造化学多样的营养景观,选择配备了兼容多糖识别、转运和降解系统的微生物类群(Flint et al., 2012; Koropatkin et al., 2012; Yu et al., 2018)。这些底物包括植物贮藏和细胞壁多糖、真菌和海洋糖苷、动物来源多糖、糖蛋白相关糖苷以及食品添加剂多糖,它们在分子量、单糖组成、糖苷键连接模式、分支拓扑结构、构象、电荷和化学修饰方面各不相同。由于其中许多糖苷对人类消化酶具有抗性或仅部分敏感,可变比例到达结肠,成为微生物利用和发酵的底物(Cockburn & Koropatkin, 2016; Makki et al., 2018)。
在这个竞争激烈的生态系统中,降解特定多糖的能力有助于生态适应和生态位分化(Grondin et al., 2017)。这些底物的利用支持细菌生长,并可导致短链脂肪酸(SCFA)的产生以及其他代谢物的形成,有助于宿主能量供应并影响免疫、代谢和屏障功能(Yu et al., 2025)。
微生物接触复杂糖苷需要兼容的碳水化合物活性酶(CAZymes)以及相关的结合、转运和调控模块。例如,普氏菌属的许多成员编码众多多糖利用位点(PULs)和广泛的CAZyme库,其中包括糖苷水解酶、多糖裂解酶和碳水化合物酯酶(El Kaoutari et al., 2013; Foley et al., 2016)。这些系统可提供可观的底物多样性,使多种复杂糖苷得以处理。对代表性拟杆菌门物种的机制研究表明,底物识别、细胞表面初始裂解、寡糖摄取和周质加工如何在一个单独利用途径中协调进行,同时也揭示了PUL组织和催化策略的显著差异(Cuskin et al., 2015; Larsbrink et al., 2014)。除单个多糖利用途径外,Song等人强调了多糖与肠道菌群之间的双向关系:肠道微生物降解不可消化的多糖以用于生长和代谢,而多糖可作为益生元底物重塑微生物群落并可能缓解与菌群失调相关的疾病(Song et al., 2021)。较新的综述考察了这一广泛的多糖-菌群-健康关系更具体的结构和机制维度。X. Sun等人讨论了碳水化合物利用差异和CAZyme库如何塑造微生物竞争和交叉喂养,对精准菌群调节具有重要意义(Sun, Pei, et al., 2025)。Subhash等人综述了多糖来源、结构特征、化学修饰、微生物代谢和功能结局之间的关系(Subhash et al., 2026)。Keung等人结合当前知识综合与159种纯化天然多糖的相关分析,将分子量、单糖组成和糖苷键连接与肠道菌群响应联系起来(Keung et al., 2025)。Y. Sun等人专注于常见非淀粉多糖的结构、肠道降解和菌群相关代谢效应(Sun, Yao, et al., 2025)。总体而言,这些综述推进了对多糖-菌群相互作用的结构、酶学、生态和功能方面的整合。在本综述中,我们采用互补的五阶段框架,涵盖底物识别与感知、初始裂解、寡糖转运、周质或胞质内次级加工,以及单糖分解代谢与产物形成,以比较细菌谱系间和化学多样糖苷类别间的已表征利用系统。
相应地,本综述围绕五个功能相连的阶段组织关于膳食糖苷利用的当前证据:底物识别与感知、初始裂解、寡糖转运、周质或胞质内次级解聚与去修饰,以及单糖分解代谢与产物形成。这些阶段为比较肠道细菌谱系间已表征利用系统提供共同基础,并探讨分子量、单糖组成、糖苷键连接模式、分支、构象、电荷和化学修饰如何影响植物贮藏和细胞壁多糖、真菌和海洋糖苷、动物来源多糖、糖蛋白相关糖苷以及食品添加剂多糖的处理。我们进一步探讨了如何利用多糖感知模块,尤其是与PULs相关的模块,构建饮食响应型工程微生物,从而将多糖利用的机制知识连接到肠道菌群干预设计。

章节片段

膳食多糖的消化与代谢

膳食多糖和饮食或宿主相关的糖缀合物是由不同单糖通过独特糖苷键连接组成的结构多样糖苷。其结构特征包括单糖组成(Xie et al., 2025)、糖苷键类型、主链和侧链结构、分子量、溶解性、高级构象以及乙酰化、甲基化和硫酸化等取代修饰(Klassen et al., 2021; Koropatkin et al., 2012)。

微生物利用膳食多糖的机制

在肠道细菌中,多糖利用由功能相连的组分组成,包括底物识别与感知、初始裂解、寡糖转运、周质或胞质内次级加工,以及单糖分解代谢与产物形成。这些组分的顺序和细胞定位在底物和细菌谱系间各不相同,而可诱导调控系统根据底物可用性协调途径表达。

结论

通过将膳食糖苷利用组织为五阶段分析框架,本综述将底物结构与功能相连的组分联系起来,包括识别与感知、初始裂解、寡糖转运、次级解聚与去修饰,以及单糖分解代谢与产物形成。比较主要细菌谱系以及植物、真菌、海洋、动物来源、糖蛋白相关和食品添加剂多糖的已表征系统

CRediT作者贡献声明

Wenchen Yu:概念化;方法学;形式分析;调查;可视化;原稿撰写;审阅与编辑;监督;项目管理;资金获取。Cuihong Dai:数据整理;形式分析;审阅与编辑。Tianyi Wang:概念化;方法学;审阅与编辑。Jiaren Liu:数据整理;可视化;审阅与编辑。Alejandro Cifuentes:资源;审阅与编辑。Elena Iba?ez:

关于生成式AI及AI辅助技术在稿件准备过程中使用的声明

在本文准备和修订过程中,作者仅使用ChatGPT进行语法检查。使用该工具/服务后,作者根据需要审阅并编辑了文本,对已发表论文内容承担全部责任。

利益冲突声明

作者声明不存在已知的竞争性经济利益。

致谢

本研究由黑龙江省头雁团队(HITTY–20190034)、航空航天科学与技术协同创新中心项目(BSAUEA5740600223)、工业和信息化部重大慢性疾病防控科学技术与智能设备重点实验室(MCD–2025–2–01)以及黑龙江省博士后科学基金(No. LBH–Z25169)资助。
Wenchen Yu|Cuihong Dai|Tianyi Wang|Jiaren Liu|Alejandro Cifuentes|Elena Ibá?ez|Weihong Lu
哈尔滨工业大学 生命科学与医学学部 医学院,中国哈尔滨
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号