环境DNA证据支持神话中的日本淡水鱼“Jindai Dojo”的存在，并证实它与一种在日本东部发现的此类物种属于同一物种

《Scientific Reports》：Environmental DNA supports persistence of the mythical Japanese freshwater fish “Jindai Dojo” and its conspecificity with an Eastern Japanese relict species

　　

摘要

环境DNA（eDNA）分析能够帮助检测隐秘和稀有的物种，并识别它们的遗传谱系，即使这些物种无法通过传统的调查方法被发现。这种淡水鱼类在本地被称为“Jindai Dojo”，历史上主要分布于日本本州中部的伊贺市。形态学证据表明，它与“Ichthyomycteris”属的I型物种属于同一物种，这是一种分布于日本东部的隐秘物种，具有高度的保护价值。然而，长期以来人们一直认为“Jindai Dojo”已经灭绝，其分类身份及其是否仍然存活至今都尚未通过遗传证据得到验证。因此，我们将针对“Ichthyomycteris”属I型物种的特异性eDNA检测方法与系统地理学框架相结合，分析了从伊贺市及其周边33个地点采集的水样。在6个地点检测到了“Ichthyomycteris”属I型物种的eDNA，其中3个地点位于“Jindai Dojo”历史分布范围内，另外3个地点位于此前未有过采集记录的河流流域。对扩增后的线粒体DNA片段进行的序列分析显示，所有检测结果都属于“Ichthyomycteris”属I型物种的日本海侧分支J亚群。这些发现支持了“Jindai Dojo”与“Ichthyomycteris”属I型物种同种的假设，并表明该物种的基因谱系在该物种的历史分布范围及其邻近河流流域中仍然存在。我们的研究证明了将物种特异性eDNA检测方法与系统地理学信息相结合，对于重新发现受威胁的物种谱系以及明确被认为已灭绝生物的分类身份具有重要意义。