ChromSkills能够实现可解释且基于领域特性的染色质数据分析

《Genome Biology》：ChromSkills enables interpretable and domain-guided agentic chromatin data analysis

　　

摘要

高通量染色质分析需要灵活的工作流程和基于上下文的参数选择。然而，不受限制的大型语言模型分析可能会面临工具选择、参数设置和执行不一致的问题。我们提出了ChromSkills，这是一个专门为在支持Skills的编码代理平台上进行染色质数据分析而设计的领域特定分析技能库。ChromSkills将专家决策逻辑和参数选择规则编码为模块化、人类可读的技能，这些技能与结构化的工具接口相连，从而实现了从自然语言任务出发的可解释工作流程组合和一致的执行。在多个代表性分析中，ChromSkills提高了工具和参数的一致性、执行的稳定性以及数据处理效率，为AI辅助的染色质数据分析提供了一个透明且基于领域的框架。