完全新辅助治疗后局部晚期直肠癌的肠道微生物群谱：与健康对照的比较及其与生存的相关性

《Scientific Reports》：Gut microbiome profiles in locally advanced rectal cancer after total neoadjuvant therapy: comparisons with healthy controls and associations with survival

　　

摘要

肠道微生物组在结直肠癌发生中起关键作用，但在局部晚期直肠癌（LARC）中其组成和预后相关性仍未得到充分探索。本研究旨在评估微生物多样性，识别与健康对照组相比 LARC 患者的不同细菌特征，并评估微生物组组成与临床结局之间的关联。在这项前瞻性队列研究中，使用 16 S rRNA 基因测序将 62 例 LARC 患者启动全程新辅助治疗（TNT）前的基线粪便样本与 30 例健康对照组的样本进行比较。评估了 Alpha 多样性（香农指数和基尼 - 辛普森指数）和 Beta 多样性（带有 PERMANOVA 的 Bray-Curtis 相异度）。使用线性判别分析效应大小（LEfSe）鉴定差异分类单元。在 LARC 队列内进行了生存分析，包括根据最佳截断点定义的变形菌门丰度进行分层的探索性 Kaplan-Meier 分析。在基线时，与健康对照组相比，LARC 患者显示出显著降低的微生物 Alpha 多样性（香农指数，p?<?0.0001）和不同的微生物群落组成（PERMANOVA，p?=?0.001）。门水平分析显示，LARC 患者中芽孢杆菌门减少，拟杆菌门和梭杆菌门增加。在生存分析中，生存组和非生存组之间的 Alpha 和 Beta 多样性无显著差异。然而，非生存者中变形菌门显著富集（p?=?0.002），此外广古菌门和隐匿微生物门的相对丰度也较高。LEfSe 分析鉴定了与生存相关的不同微生物特征，生存者中邓肯氏粪杆菌（Faecalibacterium duncaniae）和产乙酸糖发酵菌（Saccharofermentans acetigenes）富集，而非生存者中海洋梭菌（Clostridium oceanicum）和齿韦荣氏菌（Veillonella denticariosi）富集。4.5% 的最佳截断点确定了一个高危组，在 Kaplan-Meier 分析中其总生存期显著缩短。与健康个体相比，LARC 患者表现出明显的基线肠道微生物组失调。尽管全局多样性指标未能预测生存情况，但特定的分类学转变——特别是变形菌门的富集——与较差的结局相关。鉴于事件数量较少（n?=?10）以及用于定义丰度组的探索性、数据衍生截断点，这些发现应被视为需要更大、独立队列验证的候选关联，而不是已建立的预后生物标志物；尽管如此，它们仍指向了基线菌群失调与接受 TNT 患者炎症通路之间可能存在联系。