摘要
真核生物蛋白质编码基因的核心启动子中的核苷酸基序在RNA聚合酶II（Pol II）的转录过程中起着重要作用。我们分析了位于TATA框位置的一个八核苷酸的作用。根据该八核苷酸是否能够与TATA结合蛋白（TBP）形成复合物，启动子被分为含有TATA序列的和不含TATA序列的两类。我们研究了哺乳动物和植物中含TATA序列与不含TATA序列的启动子在一级结构、空间结构以及动态特性方面的差异。我们将EPDnew数据库中六种生物（H. sapiens、M. musculus、C. familiaris、A. thaliana、Z. mays和H. vulgare）的完整启动子集合分为含TATA序列的和不含TATA序列的两部分。在所有研究的生物中，含TATA序列的启动子部分的大小都显著小于不含TATA序列的部分，仅在A. thaliana中，这两部分的大小大致相等。我们通过各种碱基对步长参数的变化谱、 minor-groove宽度以及天然DNA的构象动态来表征启动子的结构。含TATA序列与不含TATA序列的启动子在其结构上存在显著差异。本文还讨论了DNA结构特征对两种类型启动子中前起始复合物（PIC）形成的可能机制影响。
