Plotgardener 应用程序：一个用于生成可用于发表的基因组可视化图表的图形界面

《Bioinformatics》：Plotgardener App: a graphical interface for publication-ready genomic visualization

　　

摘要

概述

Plotgardener是一个用于生成高质量基因组可视化图的R包。尽管它功能强大且用途广泛，但对编程的依赖性仍然对许多潜在用户构成了障碍。为了解决这个问题，我们开发了Plotgardener的macOS桌面应用程序版本，用户无需编程经验即可创建可用于发表的基因组图表。该应用程序采用模块化架构，包括一个Electron.js后端、一个React前端和一个Python解析器，后者可以动态分析Plotgardener包的内容，以确保界面元素与包的更新保持同步。通过降低高级基因组可视化的技术门槛，Plotgardener桌面应用程序为研究人员和临床医生提供了更便捷的可视化工作流程。

可用性

目前发布的Plotgardener应用程序是一个基于Electron（Node.js）的开源macOS桌面应用程序，采用React前端和基于Python的解析器。下载链接可在https://phanstiellab.github.io/plotgardener/articles/guides/plotgardenerApp.html和Zenodo（doi：https://doi.org/10.5281/zenodo.21684228）上找到。源代码托管在GitHub上，网址为https://github.com/rishabhsvemuri/ThePlotgardenerApp。

补充信息

https://phanstiellab.github.io/plotgardener/找到。