西南中国多民族听力损失患者20种常见耳聋基因罕见变异的谱及潜在致病性分析

《Human Genomics》：Spectrum and potential pathogenicity of rare variants in 20 common deafness genes among multi-ethnic hearing loss patients from southwestern China

　　

摘要

听力损失是一种常见疾病，涉及超过 200 个基因，其中一些基因携带罕见变异。这些变异在中国西南部多样民族群体中的分布尚不清楚。在本研究中，我们分析了来自中国西南部 477 名患者的 20 个常见听力受损基因在 3′、5′?UTR、剪接和外显子区域的罕见变异，这些患者代表四个语系（汉语支、藏缅语族、壮侗语族和苗瑶语族）和 15 个民族。鉴定出大量罕见变异，其中超过一半位于外显子区域。这些外显子变异在汉语支和藏缅语族群体中最常见，且两者之间分布存在显著差异。这些变异高度富集于包括 USH2A、TRIOBP、MYO15A 和 MYO7A 在内的基因中。超过 20% 的外显子变异被 MutationTaster 预测为有害变异，MYO7A 在两个主要语系中包含的有害变异比例相对于其总变异数最高。两种小鼠错义变异（c.617G>A 和 c.5254 C>T）的功能分析，它们是被鉴定的人类罕见变异的同源物，证实了它们对基因功能的破坏性影响。我们的研究结果揭示了在中国西南部多民族听力损失群体中存在独特的罕见潜在有害变异谱，突出了该地区需要进一步研究以改善基因诊断和遗传咨询的必要性。