《Industrial Crops and Products》:High endophytic fungal diversity and the antagonistic
Aspergillus niger Bzrh13 are associated with
Atractylodes macrocephala root rot resistance
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健康白术(Atractylodes macrocephala)根茎携带更高的内生真菌多样性及独特的群落组成。禾谷镰孢(Fusarium graminearum)Qssd1与尖镰孢(F. oxysporum)Qsrd11为致病力最强的根腐病病原菌。黑曲霉(Asp
健康白术(Atractylodes macrocephala)根茎携带更高的内生真菌多样性及独特的群落组成。禾谷镰孢(Fusarium graminearum)Qssd1与尖镰孢(F. oxysporum)Qsrd11为致病力最强的根腐病病原菌。黑曲霉(Aspergillus niger)Bzrh13可抑制Fusarium生长、分生孢子萌发及病害进程。经qRT-PCR验证,Bzrh13下调Fusarium霉菌毒素生物合成基因。
研究背景与立项依据
白术为价值极高的传统药用植物,其干燥根茎是调节胃肠功能与增强宿主免疫的核心药材,在安徽、浙江、四川等多省栽培。其中安徽为核心产区,包括亳州(Bozhu)、潜山(Shuzhu)、祁门(Qizhu)三大基地。根腐病被称为“植物癌症”,可造成5%–20%首年减产、连作后达50%,年均损失约30%,并通过产生霉菌毒素抑制苍术内酯Ⅰ与苍术酮等活性成分积累。该病由土传真菌与环境胁迫(排水不良、连作)协同驱动,且病原菌存在显著地域分化:浙江以尖镰孢为主,湖北恩施以Ceratobasidium sp.为独特病原。安徽产区主导病原尚不清楚。传统培养法仅能捕获20%–40%微生物,单基因鉴定难以区分近缘病原;高通量ITS测序结合多基因(ITS、TEF-α、RPB2)系统发育可弥补上述缺陷。化学杀菌剂易致抗药性与残留,而生防内生真菌兼具抑菌与促生潜力,但其与Fusarium互作的转录调控机制及体内防效验证仍稀缺。该研究发表于《Industrial Crops and Products》,旨在厘清安徽白术根腐病主导病原、内生真菌群落失调规律及黑曲霉Bzrh13的拮抗分子机制。
主要关键技术方法
研究人员于2023年10月花期在安徽潜山(QS)、祁门(QM)、亳州(BZ)三产区采集健康与发病根茎各5株及根际土,每产区5生物学重复。采用培养非依赖法(ITS1扩增、Illumina NovaSeq 6000 PE250、DADA2降噪、97%相似度OTU聚类、UNITE 8.2注释)与培养依赖法(表面消毒组织分离、梯度稀释分离、多基因系统发育)双轨并行。致病性以离体根茎(7 d病斑ImageJ量化)与盆栽一年生苗(伤根灌孢105 mL-1、45 d挖根评估)验证并回接柯赫法则。拮抗以对峙培养、发酵滤液(5%/10%/15% v/v)抑菌率、WA玻片孢子萌发抑制评估。转录组以Fg(对照PDA)与FgAn(PDA+5% Bzrh13无菌滤液)培养Qssd1,DNBSEQ-T7测序、HISAT2比对PH-1(ASM24013v3)、DESeq2筛|log2FC|>1且adj P<0.05的DEG,GO/KEGG富集。qRT-PCR用TEF-1α内参2?ΔΔCt法验证毒素基因,UHPLC-MS/MS(ESI-MRM)定量玉米赤霉烯酮(ZEN)。
研究结果
3.1 健康与发病根茎真菌菌群差异:健康样本α多样性更高
三产区共获高质量ITS序列约339万条。健康根茎OTU数(QS 499、QM 1171、BZ 883)均高于发病组(QS 372、QM 414、BZ 321)。α多样性(Chao1、Shannon、Simpson)在QM、BZ健康组极显著升高(P<0.01),QS健康组Chao1与Simpson显著升高。PCoA与PERMANOVA显示健康/发病群落显著分离(R2=0.25–0.32,P≤0.009),表明根茎健康状态解释25%–32%真菌结构变异。
3.2 核心菌群组成显著偏移:Fusarium在发病组主导,Aspergillus/Cladosporium在健康组富集
子囊菌门(Ascomycota)为优势门,担子菌门(Basidiomycota)随发病下降。属水平发病根茎Fusarium相对丰度23.5%–87.0%,较健康组(0.6%–8.0%)升高3.2–145倍;健康组Aspergillus由发病组锐减(QS 43.4%→8.8%、QM 9.7%→0.5%、BZ 19.0%→0.1%)。LEfSe(LDA>4)确认Fusarium为发病 biomarker,Aspergillus、Cladosporium、Sterigmatomyces为健康 biomarker。
3.3 共现网络揭示Fusarium与Aspergillus/Cladosporium稳定负相关
三产区网络密度0.32–0.46,QM最复杂。Fusarium与Aspergillus、Cladosporium Spearman r=?0.606~?0.842(FDR P<0.05),QM网络负相关最强(r=?0.842/?0.818)。
3.4 F. graminearum Qssd1与F. oxysporum Qsrd11致病力最强
从发病根茎及根际土分离28株候选病原(50%为Fusarium属)。离体接种7 d后Qssd1(28.83±3.25 mm2)、Qsrd11(27.5±1.68 mm2)病斑最大;盆栽45 d后两株致下部叶黄化萎蔫、根茎典型腐烂,回接ITS相似度>96%符合柯赫法则。
(后续章节依原文顺序浓缩:3.5–3.7 内生真菌分离鉴定出Bzrh13为黑曲霉,对峙培养有抑制带,5%滤液抑菌率最高,WA玻片4 h起抑制Qssd1分生孢子萌发;3.8 转录组显示FgAn中霉菌毒素合成基因(如ZEN通路PKS)下调,qRT-PCR与ZEN-UHPLC-MS/MS佐证毒素减少;3.9 离体根茎Bzrh13滤液预处理使病斑缩小,盆栽中FgAn组病情指数低于Fg组,存活率提升,防效显著。)
讨论与结论翻译
讨论指出,安徽白术根腐病为Fusarium属(尤其禾谷镰孢Qssd1、尖镰孢Qsrd11)主导,区别于浙江与湖北病原谱,印证了病理地域特异性。健康根茎高内生真菌多样性尤其是Aspergillus(含黑曲霉Bzrh13)与Cladosporium富集,构成拮抗Fusarium的生态屏障,群落失调(多样性降、Fusarium扩、有益菌退)是发病前兆。Bzrh13经发酵代谢产物抑制Qssd1菌丝生长与分生孢子萌发,并在转录水平下调霉菌毒素生物合成基因、降低ZEN积累,离体与盆栽均验证其生防效力。该研究将培养非依赖群落解析与培养依赖菌株验证耦合,为安徽产区提供了“监测内生真菌多样性+施用Bzrh13滤液/菌剂”的精准生防路径,规避化学药剂抗性风险。结论:健康白术根茎具更高内生真菌多样性与特异组成;F. graminearum Qssd1与F. oxysporum Qsrd11为安徽产区最强根腐病原;A. niger Bzrh13抑制Fusarium生长、分生孢子萌发及病害进展;Bzrh13经qRT-PCR证实下调Fusarium霉菌毒素生物合成基因。