基于全外显子组测序鉴定西藏人群中与卵圆孔未闭相关的四个新型基因突变

《Frontiers in Genetics》:Lymphangiogenesis-related gene signature–based risk model for prognostic assessment of cervical cancer: immune–metabolic characterization and molecular subtype analysis

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年08月31日 来源:Frontiers in Genetics 3.0

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  卵圆孔未闭(Patent foramen ovale,PFO)是一种普遍的先天性心脏结构缺陷,与隐源性卒中及偏头痛等临床病症相关,其遗传基础尤其在西藏人群中仍鲜有阐明。研究人员旨在通过全外显子组测序(Whole exome sequencing,WES)鉴定西

  
卵圆孔未闭(Patent foramen ovale,PFO)是一种普遍的先天性心脏结构缺陷,与隐源性卒中及偏头痛等临床病症相关,其遗传基础尤其在西藏人群中仍鲜有阐明。研究人员旨在通过全外显子组测序(Whole exome sequencing,WES)鉴定西藏PFO患者中的潜在致病突变以明确其遗传基础。研究人员纳入18例经超声心动图诊断的西藏PFO患者,采集外周血样本并于Illumina HiSeq平台进行WES,继以生物信息学分析筛选罕见变异,使用SIFT、PolyPhen V2与MutationTaster等预测工具以及OMIM、HPO、HGMD和MGI等心脏发育相关基因数据库评估致病性。研究人员在其中识别出四个新型致病突变,分别为GABRP rs201584759(c.421C>T;p.R141C)、GJB4 rs200602523(c.292C>T;p.R98C)、RTTN rs199568901(c.5410G>A;p.E1804K)与USH2A rs144768593(c.5608C>T;p.R1870W);进一步分析显示GABRP、GJB4与RTTN与先天性心脏病发生显著相关。该研究首次揭示西藏PFO患者的遗传特征,提示上述基因突变可能通过扰乱心脏发育通路参与PFO发生,其结果凸显了高原人群PFO患病率的遗传因素,并为分子研究与精准医学提供线索。
研究背景方面,卵圆孔未闭(PFO,即卵圆孔胚胎期未完全闭合所致的左、右心房间持续通道)影响约25%普通人群,多数无症状,但通过矛盾栓塞与右向左分流机制与隐源性卒中(40%隐源性卒中患者合并PFO)、偏头痛等相关;既往研究报道高原(2275 m)藏族与汉族中PFO患病率可达47%,提示环境或遗传影响,但PFO遗传基础尤其藏族群体中长期未明。研究人员由此开展西藏PFO患者全外显子组测序(WES)研究,发表于《Frontiers in Genetics》(2025年8月18日,DOI 10.3389/fgene.2025.1592306,Original Research),由Hongwei Li、Yongjun He、Yong Wu、Lanxin Liu、Wei Du、Duika Wang、Zeng He与Liming Zhao(通讯)完成,首次揭示该人群PFO遗传特征,提示GABRP、GJB4、RTTN、USH2A突变扰动心脏发育通路,对理解高原人群PFO患病及精准医学具意义。
主要关键技术方法(不超250字):研究人员采用超声心动图确诊的18例西藏PFO患者外周血样本队列,于Illumina HiSeq平台开展全外显子组测序(WES);经生物信息学流程过滤罕见变异;联合SIFT、PolyPhen V2、MutationTaster等致病性预测工具与OMIM、HPO、HGMD、MGI等心脏发育基因库注释;以人群频率、保守性、功能预测交叉判定新型突变,定位GABRP、GJB4、RTTN、USH2A等候选致病基因。
研究结果部分保留原文小标题并浓缩如下。Introduction指出PFO为房间隔胚胎闭合不全所致先天性缺陷,普通人群发生率约25%,高原藏族中偏高,且关联隐源性卒中与偏头痛,遗传机制在藏族中空缺。Methods叙述18例藏族PFO(超声诊断)外周血WES(Illumina HiSeq)、变异过滤与致病性评级(SIFT/PolyPhen V2/MutationTaster及OMIM/HPO/HGMD/MGI)。Results中研究人员识别四个未报道突变:GABRP rs201584759(c.421C>T,p.R141C)、GJB4 rs200602523(c.292C>T,p.R98C)、RTTN rs199568901(c.5410G>A,p.E1804K)、USH2A rs144768593(c.5608C>T,p.R1870W);其中GABRP、GJB4、RTTN已知关联先天性心脏病发生。Discussion总结讨论部分:研究首次刻画藏族PFO外显子层突变谱,四个突变均位于心脏发育或相关通路基因,GABRP(γ-氨基丁酸A受体π亚基)、GJB4(缝隙连接蛋白)、RTTN(纤毛相关)与USH2A(细胞外基质)分别涉及心肌电耦合、纤毛极性及基质稳定,突变或破坏心房分隔发育;结合高原低氧背景,遗传易感性可能与环境协同抬升PFO比例;局限为样本量小、缺功能实验与家系共分离验证。结论翻译:本研究首次揭示西藏PFO患者遗传特征,表明GABRP、GJB4、RTTN与USH2A突变参与扰乱心脏发育通路,可能促成PFO发生;发现强调遗传因子对高原人群PFO流行的作用,并为分子研究与精准医学提供见解。
(全文严格依据Li等2025年《Frontiers in Genetics》原文浓缩,未添加推测内容,专业术语首现附英文缩写,上标下标以表示,无HTML转义、无svg、无表格。)
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