野生与圈养罗氏攀蜥（*Teratoscincus roborowskii*）环境适应性的综合评估：肠道微生物群、代谢组学特征及生理学

《BMC Genomics》：Comprehensive evaluation of environmental adaptability in wild and captive Teratoscincus roborowskii: gut microbiota, metabolomic profiles, and physiology

　　

摘要

背景

动物肠道微生物在宿主免疫、营养代谢和能量获取中发挥着重要作用。圈养环境会显著影响肠道微生物的丰度和群落结构。

方法

本研究进行了控制饲喂实验，并采用 16 S rRNA 测序和代谢组学，以调查野生和圈养罗氏沙蜥（T. roborowskii）的肠道微生物、代谢物谱和生理状况。

结果

结果表明，各组的主要微生物组分由厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门构成，野生蜥蜴中还富集了疣微菌门，而饲喂面包虫的个体中梭杆菌门有所增加。此外，与野生组相比，圈养导致罗氏沙蜥肠道微生物多样性降低。野生罗氏沙蜥表现出更高的代谢活性，氨基酸代谢和亚油酸代谢通路显著富集。相比之下，以面包虫和蟑螂按 1:1 比例饲喂的个体中观察到赖氨酸降解发生改变。野生蜥蜴的 α-淀粉酶和纤维素酶活性较高，而高蛋白饮食的圈养蜥蜴胰蛋白酶活性升高。此外，圈养蜥蜴的白细胞计数较高，而野生蜥蜴则具有更强的抗氧化能力。

结论

圈养显著影响了 Chao1 指数，但在其他 α 多样性指数中未观察到显著差异。值得注意的是，圈养改变了罗氏沙蜥的群落结构，导致代谢和消化酶活性发生变化，并伴有免疫状态的变化趋势；而野生个体则表现出增强的代谢适应能力和抗氧化能力。本研究为了解沙漠蜥蜴的肠道微生物提供了宝贵的见解，并为圈养条件下宿主健康管理奠定了理论基础。

图形摘要

背景

动物肠道微生物在宿主免疫、营养代谢和能量获取中发挥着重要作用。圈养环境会显著影响肠道微生物的丰度和群落结构。

方法

本研究进行了控制饲喂实验，并采用 16 S rRNA 测序和代谢组学，以调查野生和圈养罗氏沙蜥（T. roborowskii）的肠道微生物、代谢物谱和生理状况。

结果

结果表明，各组的主要微生物组分由厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门构成，野生蜥蜴中还富集了疣微菌门，而饲喂面包虫的个体中梭杆菌门有所增加。此外，与野生组相比，圈养导致罗氏沙蜥肠道微生物多样性降低。野生罗氏沙蜥表现出更高的代谢活性，氨基酸代谢和亚油酸代谢通路显著富集。相比之下，以面包虫和蟑螂按 1:1 比例饲喂的个体中观察到赖氨酸降解发生改变。野生蜥蜴的 α-淀粉酶和纤维素酶活性较高，而高蛋白饮食的圈养蜥蜴胰蛋白酶活性升高。此外，圈养蜥蜴的白细胞计数较高，而野生蜥蜴则具有更强的抗氧化能力。

结论

圈养显著影响了 Chao1 指数，但在其他 α 多样性指数中未观察到显著差异。值得注意的是，圈养改变了罗氏沙蜥的群落结构，导致代谢和消化酶活性发生变化，并伴有免疫状态的变化趋势；而野生个体则表现出增强的代谢适应能力和抗氧化能力。本研究为了解沙漠蜥蜴的肠道微生物提供了宝贵的见解，并为圈养条件下宿主健康管理奠定了理论基础。

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