Egr基因在海参Eupentacta fraudatrix内脏器官再生中的作用

《Tissue and Cell》：Egr Gene in Visceral Organ Regeneration in the Holothurian Eupentacta fraudatrix

　　

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  E. fraudatrix 拥有 EGR 家族中的一个代表基因，该基因与其他棘皮动物和脊索动物的 EGR 基因具有同源性。
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  egr 基因在内脏被取出后的再生过程中，在体腔上皮和组织中表达。
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  Egr 基因的敲低会导致肠道腔发育异常、过度的细胞外基质（ECM）降解以及肠道和体腔上皮的分化延迟。

章节摘录

引言

海参（Holothuroidea）是一类独特的海洋无脊椎动物，其特点是能够再生多种组织和器官（Dolmatov 等，2014）。这一特性使它们成为研究再生分子和细胞机制的宝贵模型生物，这可能有助于理解其他动物和人类的组织修复过程。几种海参的再生基于...

序列分析和树状图构建

为了进行分析，使用了从 NCBI 数据库获取的核苷酸序列（ https://www.ncbi.nlm.nih.gov ），包括海胆 Strongylocentrotus purpuratus（Stimpson, 1857）、海星 Asterias rubens（Linnaeus, 1758）、海参 Holothuria leucospilota（Brandt, 1835）、人类 Homo sapiens（Linnaeus, 1758）、青蛙 Xenopus laevis（Daudin, 1802）、鱼类 Danio rerio（Hamilton, 1822）、文昌鱼 Branchiostoma belcheri（Gray, 1847）以及栉水母 Ciona 的序列。

基因转录本的鉴定与分析

对先前测序的 E. fraudatrix 转录本进行 BLAST 分析后，发现了一个转录本（包含完整的编码序列，共 1581 个碱基对），该转录本与脊椎动物的 EGR 家族基因具有同源性。为了确认该序列属于 EGR 家族，构建了一棵树状图（图 2）。从该转录本衍生的假想氨基酸序列与其他棘皮动物的 Egr 蛋白质聚类在一起，而这些 Egr 蛋白质又与脊索动物和半索动物的 EGR 蛋白质聚类在一起。

讨论

获得的数据表明，E. fraudatrix 拥有 EGR 家族中的一个代表基因，该基因与其他棘皮动物、脊索动物和半索动物的 EGR 基因具有同源性。存在一个编码关键 DNA 结合结构域的区域，该结构域由三个串联的 C2H2 锌指基序组成，这使得 egr 基因可以被视为其他动物中 EGR 基因的功能类似物，并保留了该家族的调控特性，因此需要进一步研究其功能。

结论

根据获得的数据可以得出结论：E. fraudatrix 拥有 EGR 家族中的一个代表基因，该基因与其他脊索动物和棘皮动物的 EGR 基因具有同源性。存在一个 DNA 结合结构域（三个串联的 C2H2 锌指）表明这种蛋白质保留了该家族的调控特性，并且与其他动物的 EGR 转录因子具有功能相似性。

研究空间和时间表达动态的结果表明...

作者声明

我们确认所有列出的作者均符合作者资格标准，没有遗漏任何合格贡献者。

所有作者都已阅读并批准了手稿的最终版本，并同意对工作的所有方面负责。

作者声明他们没有已知的利益冲突或可能影响本文报道工作的个人关系。

作者声明没有利益冲突。

Vladimir A. Nizhnichenko | Konstantin A. Sadriev | Alexander S. Girich | Yaroslav O. Kamenev | Alexey V. Boyko | Igor Yu. Dolmatov