通过抑制群体感应活性来降低铜绿假单胞菌的毒力:一项分子对接与分子动力学模拟研究

《ChemistrySelect》:Pseudomonas aeruginosa Virulence Reduction Through Phytochemical Inhibition of Quorum Sensing Activity: A Molecular Docking and Molecular Dynamics Simulation Study

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月01日 来源:ChemistrySelect 2.3

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   摘要 铜绿假单胞菌是一种机会性病原体,它利用群体感应(QS)来调节毒力和生物膜的形成,从而导致多重耐药性(MDR)的出现。本研究旨在从

  

摘要

铜绿假单胞菌是一种机会性病原体,它利用群体感应(QS)来调节毒力和生物膜的形成,从而导致多重耐药性(MDR)的出现。本研究旨在从Cistus munbyi的精油中识别出可能抑制铜绿假单胞菌中LasR QS受体的植物化合物。研究人员通过分子对接研究筛选了44种植物化合物,这些化合物针对LasR及其变体(LasR-Var1:R144I和LasR-Var2:R180W)。茴香醛和沙丁酰乙酸被确定为最佳候选物,它们的结合亲和力与参考化合物N-3-氧代十二酰-L-高丝氨酸内酯(OdDHL)相当。分子动力学(MD)模拟在200纳秒内证实了与关键保守残基的稳定相互作用,其中茴香醛在LasR_Var2上的稳定性更佳(RMSD:0.83 ± 0.33纳米)。密度泛函理论(DFT)分析显示茴香醛(能量间隙:5.071电子伏特)和沙丁酰乙酸(能量间隙:6.162电子伏特)具有良好的化学反应性,这支持了它们作为QS抑制剂的潜力。RMSD、RMSF、Rg和SASA验证了这些复合物的结构稳定性,而基于PCA的FEL分析则突出了它们的独特构象动态。这些发现强调了茴香醛和沙丁酰乙酸作为抗QS剂来降低铜绿假单胞菌毒力和对抗MDR的潜力。该研究建议进一步进行体外验证,以便将这些计算机预测的结果转化为新的植物化学基治疗药物。

图形摘要

本研究利用计算方法探讨了Cistus munbyi精油中植物化合物作为潜在的铜绿假单胞菌群体感应抑制剂的可能性。通过对接实验,茴香醛和沙丁酰乙酸被确定为最佳候选化合物。随后的ADME分析和毒性分析显示它们具有类似药物的优良性质。分子动力学模拟证实了这些复合物的稳定性。此外,密度泛函理论(DFT)分析表明这些候选化合物具有理想的化学和电子特性。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

本研究生成和分析的所有数据均包含在已发表的文章中。支持研究结果的其他数据可在其支持信息文件中找到。

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