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南美洲乌拉圭淡水、半咸水及海洋站点的宏基因组与宏基因组组装基因组

《Scientific Data》:Metagenomes and MAGs from freshwater, brackish, and marine sites in Uruguay, South America

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月01日 来源:Scientific Data 7.2

编辑推荐:

   摘要将微生物生物地理学与功能潜力联系起来已成为近年来微生物生态学的核心主题。然而,要进行详细的全球分析,需要来自研究不足地区的样本。南美洲拥有全球约三分之一的淡水资源,就是这样一个地区。在此,我们对乌拉圭不同水生环境中的九个宏基因组进行了测序,采用了短读长(Illumina)

  

摘要

将微生物生物地理学与功能潜力联系起来已成为近年来微生物生态学的核心主题。然而,要进行详细的全球分析,需要来自研究不足地区的样本。南美洲拥有全球约三分之一的淡水资源,就是这样一个地区。在此,我们对乌拉圭不同水生环境中的九个宏基因组进行了测序,采用了短读长(Illumina)和长读长(Oxford Nanopore)技术,包括一个淡水水库、两个淡水泻湖和两个沿海泻湖(采样点跨越盐度梯度),以及邻近的南大西洋沿海海域。组装和分箱得到了 707 个完整度大于 50% 且污染度小于 5% 的宏基因组组装基因组(MAGs)。其中,超过 60% 代表潜在的新物种,尚未收录于基因组分类数据库中。至少有 159 个 MAGs 属于高质量,其中 31 个被恢复为单个环形重叠群。该数据集为未来关于水生微生物多样性、进化和生物地理学的研究提供了宝贵的资源。

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