椰枣（Phoenix dactylifera）的基础基因组资源：阿吉瓦的无间隙、端粒到端粒单倍型组装及 19 个高质量基因组组装

《Scientific Data》：Foundational genomic resources for date palm (Phoenix dactylifera): A gap-free, telomere-to-telomere phased assembly of Ajwa and 19 high-quality genome assemblies

　　

摘要

Phoenix dactylifera L.（海枣）是中东和北非干旱及半干旱地区一种在经济、营养和文化上具有重要意义的果树作物。在此，我们提供了 Ajwa（阿贾瓦）品种的无间隙、端粒到端粒参考基因组，以及另外 19 个高质量组装结果（18 个雌性，1 个雄性）。这些组装结果揭示了经过细胞遗传学、Hi-C 和光学图谱验证的更新且修正后的染色体组装。根据所有测序基因组的平均长度，重新修订了染色体编号。性别决定区域（SDR）被推断位于第 14 号染色体上，跨度约为 15.2 Mb。核仁组织区（NORs）定位于第 10 号染色体上，其中一个巨大的 45S rDNA 位点显示出包含转座子样序列的独特重复间隔子基序。在一些种质资源中，在雌性性染色体上识别出了第二个 NOR。这一系列以 Ajwa 参考基因组为核心的海枣组装结果，为推进旨在增强海枣遗传韧性和生产力的育种策略提供了基础性资源。