高粱SbANK基因家族全基因组鉴定及其盐胁迫响应特征分析
《International Journal of Molecular Sciences》:Genome-Wide Identification and Expression Pattern of the ANK Gene Family in Sorghum bicolor Under Salt Stress
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时间:2026年09月01日
来源:International Journal of Molecular Sciences 5.6
摘要
锚蛋白重复蛋白(ANKs)在植物发育及非生物胁迫响应中发挥着关键作用。本研究在全基因组水平上鉴定了高粱(Sorghum bicolor)中的ANK基因家族成员,分析了其序列特征、进化关系及表达模式,为阐明SbANK基因的功能及耐盐育种提供了科学依据。本研究利用生物信息学方法对SbANK基因家族进行了全面鉴定,分析了其理化性质、结构域组成、染色体分布、共线性关系、启动子顺式作用元件及保守蛋白基序。通过转录组数据和qRT-PCR检测了盐胁迫下其表达量的变化。本研究共在Sorghum bicolor基因组中鉴定出186个ANK家族成员,分为13个亚家族,不均匀地分布在10条染色体上。种内共线性分析发现7对重复基因,种间共线性分析表明S. bicolor与水稻(Oryza sativa)共享88对直系同源基因,远超拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的11对。启动子分析表明,SbANK基因富含与激素响应相关的顺式作用元件(特别是MeJA元件,占51.7%)以及与胁迫响应相关的顺式作用元件(特别是无氧诱导元件,占60.9%)。转录组表达分析显示,SbANK基因具有明显的组织特异性,其中ANK-IQ亚家族在高粱叶片中高表达,ANK-M亚家族在盐胁迫下表现出最为广泛的响应。利用qRT-PCR分析了10个对盐胁迫响应最为显著的候选基因的表达水平。结果表明,SbANK91、SbANK135和SbANK136在200 mmol/L NaCl处理下显著上调。SbANK家族成员基因数量众多且结构多样,其中ANK-M亚家族是对盐胁迫响应的主要群体。SbANK91、SbANK135和SbANK136被鉴定为盐胁迫响应的候选基因。
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