摘要
北美茄 (Solanum carolinense L.) 是一种广泛分布于北美洲的恶性杂草，并在其他地区日益成为入侵物种。其强大的环境适应能力、复杂的防御策略以及独特的繁殖特征，使其成为研究植物 - 食草动物协同进化的重要模型。然而，缺乏高质量的基因组资源限制了对 其适应性进化机制的深入研究。在本研究中，我们采用结合 PacBio HiFi 长读长测序、Illumina 二代测序和 Hi-C 染色质相互作用支架化的综合方法，构建了 S. carolinense 的染色体水平参考基因组组装。最终基因组组装总长度为 915.40 Mb，contig N50 为 51.06 Mb，scaffold N50 为 73.17 Mb；96.05% 的序列成功锚定到 12 条假染色体上。该基因组的特征是高比例的重复序列 (73.64%) 和显著的杂合性 (1.13%)，符合高度重复和中等高杂合基因组的特征。BUSCO 分析表明，S. carolinense 的染色体水平基因组组装完整度得分达到 94.8%。共注释了 32,206 个蛋白编码基因，其中 97.95% 获得了功能注释。对注释的蛋白编码基因集的评估返回完整度值为 94.9%。该参考基因组为推进茄科杂草物种适应性进化研究提供了宝贵资源，支持制定针对这一麻烦物种的更有效管理策略，并为组装其他高杂合性杂草基因组提供了技术参考。
