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盖亚乳杆菌新种（Lactobacillus gaiae sp. nov.）：一种从野猪粪便样本中分离出的新物种，以及关于扩展和差异化的果胶侧链利用模块的证据
《BMC Microbiology》：Lactobacillus gaiae sp. nov., a novel species isolated from wild boar fecal samples and evidence for an expanded and differentiated pectin-side-chain utilization module
【字体： 大 中 小 】 时间：2026年09月02日 来源：BMC Microbiology 5.4
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摘要分离自新加坡乌敏岛和罗弄哈路斯的野猪粪便样品中获得了三个菌株：WILCCON 0058、WILCCON 0059T 和 WILCCON 0149。16S rRNA 基因序列分析显示，这些菌株属于 Lactobacillus 属，并与 Lactobacillus delbr
分离自新加坡乌敏岛和罗弄哈路斯的野猪粪便样品中获得了三个菌株：WILCCON 0058、WILCCON 0059T 和 WILCCON 0149。16S rRNA 基因序列分析显示，这些菌株属于 Lactobacillus 属，并与 Lactobacillus delbrueckii 的模式菌株 DSM 20074T 关系最为密切（相似性为 98.53–98.80%），基因组树分析证实了这一点，显示这些菌株形成了一个独特但密切相关的聚类。这三个菌株与所有 L. delbrueckii 亚种的模式菌株（DSM 20074?, DSM 20081?, DSM 15996?, DSM 24966?, DSM 26046? 和 DSM 20072?）之间的平均核苷酸一致性 (ANI)、数字 DNA-DNA 杂交 (dDDH) 和平均氨基酸一致性 (AAI) 值分别为 92.2–92.5%、46.8–48.1% 和 94.5–95.0%，远低于物种界定阈值的既定标准。基于我们的系统发育基因组学、表型和化学分类学分析，我们提出一个新物种，命名为 Lactobacillus gaiae sp. nov.，指定 WILCCON 0059T (=DSM 120975T=LMG 34196T) 为模式菌株。有趣的是，所有菌株均显示能在果胶半乳聚糖上生长，基因组中存在两个 GH53 基因（推定的半乳聚糖酶）的产物被表达并分泌到培养基中。结合菌株对猪胆汁的耐受性及其降解棉子糖族低聚糖的能力，这表明其具有在肠道内存活、缓解胃肠道菌群失调以及增强纤维消化的潜在能力。
分离自新加坡乌敏岛和罗弄哈路斯的野猪粪便样品中获得了三个菌株：WILCCON 0058、WILCCON 0059T 和 WILCCON 0149。16S rRNA 基因序列分析显示，这些菌株属于 Lactobacillus 属，并与 Lactobacillus delbrueckii 的模式菌株 DSM 20074T 关系最为密切（相似性为 98.53–98.80%），基因组树分析证实了这一点，显示这些菌株形成了一个独特但密切相关的聚类。这三个菌株与所有 L. delbrueckii 亚种的模式菌株（DSM 20074?, DSM 20081?, DSM 15996?, DSM 24966?, DSM 26046? 和 DSM 20072?）之间的平均核苷酸一致性 (ANI)、数字 DNA-DNA 杂交 (dDDH) 和平均氨基酸一致性 (AAI) 值分别为 92.2–92.5%、46.8–48.1% 和 94.5–95.0%，远低于物种界定阈值的既定标准。基于我们的系统发育基因组学、表型和化学分类学分析，我们提出一个新物种，命名为 Lactobacillus gaiae sp. nov.，指定 WILCCON 0059T (=DSM 120975T=LMG 34196T) 为模式菌株。有趣的是，所有菌株均显示能在果胶半乳聚糖上生长，基因组中存在两个 GH53 基因（推定的半乳聚糖酶）的产物被表达并分泌到培养基中。结合菌株对猪胆汁的耐受性及其降解棉子糖族低聚糖的能力，这表明其具有在肠道内存活、缓解胃肠道菌群失调以及增强纤维消化的潜在能力。
