摘要
抗磷脂综合征（APS）是一种以血栓性和炎症性表现为特征的自身免疫性疾病，其分子调控机制尚未完全阐明。长链非编码RNA（lncRNA）和N6-腺苷酸甲基化（m6A）相关调控日益被认为是免疫基因调控的组成部分，但其在APS中的作用尚缺乏充分描述。本研究调查了BRD3OS（LINC00094）在APS中的表达情况，并探索了其与m6A相关调控的分子及预测结构背景。研究采用探索性病例-对照设计，先通过lncRNA PCR芯片发现队列筛选候选分子，再在独立队列中进行靶向RT-qPCR验证。候选分子筛选综合考虑了多项表达及技术特征，并通过敏感性分析进行评估。对BRD3OS表达、部分m6A调控因子（METTL3、METTL14、WTAP和FTO）、炎症介质及外周血单个核细胞（PBMC）总RNA中的全局m6A丰度进行了评估。采用生物信息学网络分析将BRD3OS置于APS及m6A相关分子体系中加以解读。利用RNAfold和RNAplfold分析DRACH共识基序的预测结构背景及可及性，并通过额外分析评估片段边界及综合评分的稳健性。结果发现，在独立验证队列中，APS患者PBMC中的BRD3OS显著下调。METTL3、METTL14和WTAP的表达也降低，而PBMC总RNA中的全局m6A水平升高。这些观察表明BRD3OS表达与更广泛的m6A相关分子环境存在同步改变，但尚不能证实BRD3OS发生了转录本特异性甲基化修饰。生物信息学网络分析显示BRD3OS位于与APS相关的预测RNA中心调控关系网络中。DRACH基序表现出异质性的预测结构可及性，未配对结构环境在RNAplfold推导下的可及性高于配对区域。重叠转录本片段间的定量可及性估计高度一致，但敏感性分析表明，个体排名靠前的候选分子取决于加权方案的选择。BRD3OS下调是APS中可重复验证的分子发现。全局m6A丰度及部分m6A调控因子的同步改变提示表观转录组可能存在更广泛的失调；然而，这些测量结果无法证实BRD3OS的m6A修饰或其观察结果之间的因果关系。因此，结构和网络分析为未来转录本特异性甲基化图谱绘制和功能验证的候选区域及相互作用提供了假设生成框架。
