《Animals》：Three-Phase Decline in Reported Farm-Level Fowl Typhoid Occurrence in the Republic of Korea, 2000–2024: Temporal Alignment with the 2016–2017 H5N6 HPAI Epidemic
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本研究描述了2000–2024年大韩民国全国农场级禽伤寒（由Salmonella enterica subsp. enterica血清型Gallinarum生物变型Gallinarum即S. Gallinarum引起）通报数的长期变化。研究人员从国家家畜疾病数
本研究描述了2000–2024年大韩民国全国农场级禽伤寒（由Salmonella enterica subsp. enterica血清型Gallinarum生物变型Gallinarum即S. Gallinarum引起）通报数的长期变化。研究人员从国家家畜疾病数据库获取农场级通报记录（n = 1495条），在log(计数+1)尺度上采用分段线性回归分析年度计数，并基于贝叶斯信息准则（BIC）在候选模型中优选出双断点模型。断点估计位于2009.0（95% CI，2004.7–2013.3）与2016.5（95% CI，2014.1–2019.0）。第一阶段（2000–2009）显著下降（年百分比变化APC，?16.3%；95% CI，?25.9至?5.5），第二阶段（2009–2016）无显著变化（APC，3.7%；95% CI，?10.3至20.0），第三阶段（2016–2024）加速下降（APC，?28.0%；95% CI，?34.9至?19.8）。省级2016年后斜率与2014–2024年累计省级HPAI事件无关联（Spearman’s ρ = ?0.143，p = 0.736）。2016年后的加速下降在时间上与2016–2017年H5N6 HPAI流行重叠，但研究未测量同期生物安全强度、疫苗接种覆盖率、监测投入或家禽种群与产业结构变化，故不能认定HPAI防控措施构成因果效应。结果仅描述通报数的长期模式及其与HPAI流行期的时间重叠。
研究背景方面，禽伤寒是由Salmonella enterica subsp. enterica血清型Gallinarum生物变型Gallinarum（S. Gallinarum）引起的鸡败血性细菌病，可致高发病率与死亡率及重大经济损失，经垂直与水平途径传播，在亚洲负担尤重。韩国自1990年代初将其纳入法定控制框架，2001年起在商品蛋鸡中引入减毒活疫苗SG9R（S. Gallinarum 9R），但未强制覆盖肉鸡。既往观察提示发病农场数在2002年达峰后随接种扩大而下降，但现场菌株持续演化、抗菌药物耐药上升，且2000–2024年间监测强度、生物安全投入、种群结构与报告行为均可能变化。与此同时，2016–2017年H5N6高致病性禽流感（HPAI）流行波及343个农场、扑杀约4000万羽，其应急反应含扑杀、移动限制、清洗消毒与强化监测，理论上可能改变包括禽伤寒在内的其他病原传播环境。然而，既有数据缺乏同期干预强度与分母指标，难以判断趋势转折是否由HPAI控制外溢所致。研究人员据此开展回顾性生态学时间序列研究，旨在刻画全国通报轨迹、正式选出断点数并估算各阶段年百分比变化（APC），探索省级异质性及与HPAI累积发生的关联，评估时间对齐而非建立因果。论文发表于《Animals》。
关键技术方法上，研究人员从韩国农林畜产食品部（MAFRA）公开API调取动物植物检疫局（APQA）2000–2024年1495条农场级禽伤寒通报，并以同库2014–2024年HPAI记录作省级生态上下文；年度计数取log(count+1)变换，用segmented包拟合零、一、二断点候选模型并以BIC选优，断点位置与相位斜率经数值估计获近似95% CI，APC由对数斜率指数化得；Davies检验补证斜率变更；省级分析仅纳入全期≥20起的通报省份，对2016–2024年各省拟合年度log(count+1)回归得省别斜率，与各省2014–2024累计HPAI农场事件数行Spearman秩相关。全程未调接种率、生物安全合规或农场分母。
研究结果部分，在描述性分布中，1495条通报早期偏高后长期减少但不均匀，地理集中于全罗北道、全罗南道、忠清南道等主产区，省级时空异质明显。断点与相位趋势中，BIC择定双断点模型，断点2009.0（95% CI 2004.7–2013.3）与2016.5（95% CI 2014.1–2019.0）；相位一（2000–2009）APC ?16.3%（p=0.006）显著降，相位二（2009–2016）APC 3.7%（p=0.604）平台期，相位三（2016–2024）APC ?28.0%（p<0.001）加速降，其绝对值约为相位一1.7倍；模型调整R2=0.87，残差标准误0.45（df=21），诊断图无系统偏离。省级2016后趋势中，八省六省斜率为负，全罗南北道降幅最陡，忠清北道与庆尚北道略正；累计HPAI事件与省别斜率Spearman ρ=?0.143（p=0.736），无显著关联，即HPAI高发省并未一致更快降压。
讨论部分总结，研究人员指出三相格局本身稳固：早期降与SG9R引入及卫生管理扩展时间合拍，中期平台反映垂直传播、接种不均与小农持有致低水平持续，后期加速与H5N6流行及扑杀/消毒/移动管控时间重叠，但断点CI宽（2014.1–2019.0）且省级HPAI负荷无关，故不能归因HPAI控制。替代机制含大规模扑杀缩减风险群与卫生空窗、产业结构整合、监测与诊断送检变化等，皆因缺纵向暴露数据未能分离。研究人员强调本数据库为“通报数”非“发病率”，无稳定分母、无接种覆盖序列、无场级跨病持久标识，限制因果解读；并引述COVID-19期间非药物干预致他病下降的文献仅作生物学 plausibility 参照而非本国证据。结论部分译文如下：韩国2000–2024年农场级禽伤寒通报呈BIC支持的三相模式——初期降、中期平台、2016后加速降；终段转折时间与2016–2017 H5N6 HPAI流行重叠，但研究未直测生物安全实施等同期变化，扑杀、移动限制与卫生、接种实践、监测变更及产业重组皆为不可解离之可能贡献，省级HPAI发生与2016后斜率无关。结果确立通报数的时间模式而非HPAI控制之因果效应；未来需稳分母、直接干预暴露测度与场级可靠关联以明机制。
