《Heliyon》：An integrative bioinformatics study identifies CLCA1, ZG16, AQP8, FCGBP, and SLC17A4 as potential biomarkers mediating colorectal cancer progression via cell cycle modulation
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结直肠癌（colorectal cancer, CRC）是马来西亚第二大常见癌症类型，54.3%的CRC患者在晚期III期和IV期才被确诊。近年来CRC转录组分析的增加为应用整合方法识别潜在预后生物标志物提供了前所未有的机会，这对于风险分层和治疗选择至关重要。
结直肠癌（colorectal cancer, CRC）是马来西亚第二大常见癌症类型，54.3%的CRC患者在晚期III期和IV期才被确诊。近年来CRC转录组分析的增加为应用整合方法识别潜在预后生物标志物提供了前所未有的机会，这对于风险分层和治疗选择至关重要。在本研究中，研究人员将差异共表达基因（differentially co-expressed genes, dCEGs）和差异表达基因（differentially expressed genes, DEGs）相结合的整合方法应用于来自马来西亚患者的15对非肿瘤和肿瘤组织样本的转录组数据集。研究人员构建了基于dCEG的模块化网络和基于DEG的网络，随后进行富集分析以识别基因与癌症相关通路和过程的关联。随后鉴定枢纽基因（hub genes），并进行预后分析以评估其对CRC患者总生存期的影响。dCEG研究显示，三个显著模块M1、M3和M7以及26个DEGs在肿瘤组中上调。上调基因与细胞周期相关过程（如有丝分裂细胞周期、纺锤体组织、细胞分裂和染色体组织）以及癌症相关通路（如Wnt信号通路和癌症通路）相关。总体上，研究人员发现了40个关键枢纽基因，其中五个枢纽基因的低表达与不良预后相关。这一发现与研究人员的生物学研究相符，与组织样本中CLCA1、ZG16、AQP8、FCGBP和SLC17A4的下调一致，提示这五个枢纽基因作为预后因子在通过细胞周期调控介导CRC进展中的潜在作用。这一发现对于改善生存结局和推进未来结直肠癌研究中预后生物标志物的开发至关重要。
**研究背景**
结直肠癌（colorectal cancer, CRC）是亚洲国家包括马来西亚最常见的癌症相关死亡原因之一。尽管治疗手段不断进步，转移性CRC患者的预后仍然较差，大多数CRC死亡由转移导致。CRC是一种异质性疾病，其肿瘤表型由各种分子和形态学改变与肿瘤微环境相互作用所决定，这些改变可促进肿瘤进展和转移。细胞周期失控是癌症的重要标志之一，周期蛋白依赖性激酶（cyclin-dependent kinase, CDK）活性在调控细胞周期进程中发挥关键作用。然而，在CRC背景下，除CDK基因外与
