摘要
斑点鱼（Scatophagus argus）是一种具有经济价值的鱼类物种，其性别决定方式为XX/XY系统，关键性别决定基因为Dmrt1Y。可变剪接（AS）有助于转录本的多样性和转录后调控，但其在鱼类生殖腺功能中的作用尚不明确。在这项研究中，我们利用基于ONT的全长转录组测序技术，对S. argus成年卵巢（n = 3个）和睾丸（n = 3个）中的AS事件进行了全面分析。每个样本平均获得了7.30 Gb的纯净数据，平均N50长度为1502 bp。共鉴定出3333个差异表达基因（DEGs），其中卵巢上调的基因有2064个，睾丸上调的基因有1269个。此外，在卵巢中检测到9417个AS事件，在睾丸中检测到17,216个AS事件。值得注意的是，在Dmrt1Y基因中未检测到任何AS事件。在卵巢和睾丸之间共鉴定出2253个差异可变剪接（DAS）事件，涉及1300个基因，其中只有213个基因同时存在表达差异。在与生殖腺功能和生殖细胞调节相关的基因中观察到了性别偏向的AS模式，包括Ncoa5、Tp53和Fancl。在Tp53和Fancl中，雄性偏向的AS事件改变了编码区域，分别影响DNA结合域和UBC样结构。进一步分析发现，雄性偏向的Ncoa5异构体（缺乏外显子3和4，共381 bp）可能导致RNA识别基序（RRM）的部分丢失。总体而言，本研究为S. argus成年生殖腺中的AS调控机制提供了见解，并强调了AS在生殖过程中的潜在作用。
