《Journal of Intelligence》：The African Polio Laboratory Network: Advancing Regional Poliovirus Detection, Genomic Surveillance, and Eradication
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背景：维持消灭脊髓灰质炎（脊灰）的进展，不仅需要有效的疫苗接种，还需要一个具备及时检测、确认和遗传特征鉴定能力的韧性实验室网络。在世界卫生组织（WHO）非洲区域，非洲脊灰实验室网络为消灭工作提供了至关重要的病毒学支持；然而，持续存在的循环疫苗衍生脊灰病毒（cV
背景：维持消灭脊髓灰质炎（脊灰）的进展，不仅需要有效的疫苗接种，还需要一个具备及时检测、确认和遗传特征鉴定能力的韧性实验室网络。在世界卫生组织（WHO）非洲区域，非洲脊灰实验室网络为消灭工作提供了至关重要的病毒学支持；然而，持续存在的循环疫苗衍生脊灰病毒（cVDPVs）疫情以及日益增加的基因组监测需求，仍在挑战实验室能力。尽管其作用至关重要，但描述区域脊灰实验室网络运行绩效、适应能力和演变的证据仍然有限。本研究评估了2025年非洲脊灰实验室网络的绩效和运行经验，重点介绍其对脊灰病毒检测、基因组监测、质量保证和疫情应对的贡献，同时分享经验教训，为区域公共卫生体系提供参考。
方法：采用回顾性二手数据分析，使用实验室监测和疫情数据库，并辅以规划性报告审查。分析前对数据进行了清洗和统一。采用描述性分析评估实验室工作量、及时性指标、基因组能力、质量保证绩效和运行挑战。对规划性文件进行定性审查，以识别影响绩效的背景因素。
结果：2025年，在16个实验室共分析了77,230份急性弛缓性麻痹（AFP）标本。92%的标本达到了病毒分离的及时性目标，94%达到了PCR型内鉴别（PCR-ITD）目标。基因组测序确认了10个国家的20起cVDPVs疫情。乌干达和尼日利亚新测序实验室的建立缩短了周转时间，2025年的一项扩展计划旨在另外12个国家建立测序能力。2024年接受病毒分离、PCR-ITD和环境监测评估的所有实验室均超过质量保证认证阈值，等级为“通过”。直接检测纳米孔测序（DDNS）技术的试点实施有望进一步加强基因组监测。挑战依然存在，包括关键物资缺货、工作量不均和基础设施差距。
结论：非洲脊灰实验室网络在支持WHO非洲区域消灭脊灰活动方面展现出持续的能力、适应性和创新性。本研究为加强实验室系统、扩大基因组能力和维持质量保证机制提供了证据，以支持脊灰消灭的最后阶段以及更广泛的公共卫生监测。
脊髓灰质炎（脊灰）是由脊髓灰质炎病毒引起的高传染性疾病，消灭脊灰不仅依赖疫苗和免疫策略，还依赖能够及时产生可行动数据的实验室网络。在WHO非洲区域，非洲脊灰实验室网络是消灭工作的重要支撑。尽管该区域已于2020年获得无野生脊灰病毒认证，但循环疫苗衍生脊灰病毒（cVDPVs）疫情持续暴发，且基因组监测需求不断上升，对实验室能力构成显著压力。然而，描述该区域实验室网络运行绩效、适应能力和演变过程的研究证据仍较有限。为此，研究人员基于2025年的运行数据开展了一项回顾性评估，旨在系统评价该网络在病毒检测、基因组监测、质量保证和疫情应对中的表现，并从区域经验中提炼对公共卫生体系的启示。该论文发表在《Journal of Intelligence》。
研究人员利用2025年WHO非洲区域脊灰实验室数据库、疫情数据库及规划性报告，对来自16个实验室的77,230份急性弛缓性麻痹（AFP）粪便标本进行了回顾性二手数据分析。分析前对数据进行了清洗和统一，采用描述性统计计算实验室工作量、病毒分离和PCR型内鉴别（PCR-ITD）的及时性指标、测序覆盖率和质量认证结果，同时通过定性内容分析审查工作会议记录、认证报告等文件，以识别影响绩效的背景与机制。研究未采用推断性统计检验，仅作描述性评估。测序相关分析主要针对VP1区扩增后产物，涉及区域新部署的Sanger测序平台以及试点中的直接检测纳米孔测序（DDNS）技术。
结果部分可概括为以下几个小标题内容。3.1 工作量分析与样本处理及时性方面，2025年16个实验室共处理77,230份AFP标本，其中尼日利亚伊巴丹实验室工作量最高（18,929份），其次为迈杜古里（12,878份）和刚果民主共和国（9239份）；尼日利亚和刚果民主共和国实验室合计承担了区域样本量的53%，体现出明显的工作量不均衡。3.2 病毒分离的周转时间性能方面，除埃塞俄比亚和赞比亚外，其余实验室均达到WHO建议的80%及时性目标，病毒分离中位周转时间为10～15天。3.3 PCR-ITD的周转时间性能方面，南非和埃塞俄比亚中位时间最长，除刚果民主共和国外所有实验室均达到80%目标。3.4 及时疫情通报与快速反应方面，2025年共报告22起独立脊灰病毒疫情，分布在10个国家；其中19起由2型循环疫苗衍生脊灰病毒（cVDPV2）引起，另有2起为cVDPV3、1起为cVDPV1；安哥拉报告疫情簇最多，尼日利亚和埃塞俄比亚也呈现持续传播。3.5 脊灰病毒测序、及时性和扩展计划方面，乌干达和尼日利亚伊巴丹的两个新建测序实验室于2025年投入运行，共测序1,726份病毒分离物，加纳和法国的测序周转时间最短（中位4天），伊巴丹最长（中位11天）；新实验室显著减少了原先依赖海外中心的国家的等待时间，并计划继续扩展至12个国家。3.6 实验室质量保证方面，2024年有16个实验室接受认证评估，在病毒分离、PCR-ITD和环境监测三个领域全部超过阈值，除一个实验室获得临时认证外，其余均获“通过”；实验室同时也开展了超过190名人员的培训，内容涵盖病毒分离、细胞培养、环境监测和基因组测序，由南非国家传染病研究所（NICD）等机构提供实操支持。
讨论部分指出，非洲脊灰实验室网络在多数早期检测指标上表现稳定，但工作负荷在大型实验室集中、物资供应链偶有中断等问题可能延误结果报告。研究强调，cVDPV2的占优提示需要持续进行基因组监测并深入研究病毒进化动力学。区域化测序能力建设显著缩短了从检测到应对的时限，而质量保证、同行学习及培训是维持网络韧性的关键机制。该网络还支持了WHO东地中海区域部分国家的样本检测，显示跨区域合作网络的价值。研究局限在于数据仅覆盖AFP粪便标本，可能低估实验室的全部工作量，且测序结果受数据提取时点影响。
研究结论可翻译为：本研究突显了非洲脊灰实验室网络在WHO非洲区域及时检测脊灰病毒、应对疫情和进行基因组监测方面的贡献。通过扩大测序能力、取得强有力的认证结果，以及实施协作机制来缓解供应链挑战，该实验室网络已准备好支持该区域消灭脊灰的最后阶段。尽管取得这些成就，绩效差异和供应链制约仍然存在。持续投资于基础设施、物流和技术监督，对于确保所有实验室始终如一地交付高质量、及时的结果至关重要。采用MinION和DDNS等创新型测序技术，可进一步加强近实时分子流行病学能力，加速疫情响应并支持更广泛的防范目标。随着消灭目标的临近，政策制定者和全球卫生相关方应优先将该网络纳入区域卫生安全框架，确保其持续为发现和应对新出现的公共卫生威胁作出贡献。
