利用 Olink 蛋白质组学高通量表征人成纤维细胞对一组金黄色葡萄球菌抗原蛋白的应答

《Open Forum Infectious Diseases》：High-throughput characterization of human fibroblast responses to a panel of Staphylococcus aureus antigen proteins using Olink proteomics

　　

摘要

背景

金黄色葡萄球菌 是一种主要的人类病原体，能够引发免疫炎症反应和感染，这主要由其广泛的抗原蛋白库驱动。了解这些因素对于阐明感染机制具有重要价值。

方法

将 52 种重组 金黄色葡萄球菌 抗原蛋白分别应用于培养的人真皮成纤维细胞（HDFs）中。在用抗原刺激汇合的 HDFs（52 种抗原 + 44 种对照；三个重复板）后，使用 Olink 炎症、心血管 II 和 III 蛋白质组学平台对宿主蛋白反应进行定量。数据通过无监督聚类、差异表达分析和相关性网络建模进行分析，以识别免疫炎症信号的模式。

结果

无监督分析确定了三个独特的宿主反应聚类，在层次聚类（Ward.D2）和 t-SNE 投影中观察到一致的分离。这些聚类可以大致定义为一个细胞毒性/炎症抗原聚类（Cluster_1），富集了关键毒力因子（例如 HlgA、Atl.1、SasG.2），其特征是炎症介质（包括 IL-6、IL-8、CXCL1 和 CCL3）的显著上调。一个免疫调节/表面蛋白聚类（Cluster_2），包括粘附素和免疫逃逸蛋白（例如 Chp、SSL11、Atl.2），与 AXIN1、IL-33 和 DECR1 的选择性上调相关。一个小的异常值抗原聚类（Cluster_4），由 LuKE 和 SdrD.1 组成，未表现出明确定义的宿主反应谱。差异表达分析鉴定出 12 种核心宿主蛋白——包括 COL1A1、CXCL1、CXCL16、DLK-1、GLO1、IGFBP-1、IL33、IL6、IL8、MCP-1、TNF 和 TRAIL-R2，这些蛋白在不同聚类中表现出一致且显著的变化（FDR 校正 p < 0.01）。

结论

这项初步研究表明，金黄色葡萄球菌 抗原蛋白在 HDFs 中触发了协调的免疫炎症级联反应。