基于单细胞数据揭示 Hedgehog 信号通路异常背景下弥漫大 B 细胞淋巴瘤的免疫细胞相互作用及预后模型构建

《Biology Direct》：The revelation of immune cell interaction and the building of a prognostic model in diffuse large B-cell lymphoma under Hedgehog signaling abnormalities based on single-cell data

　　

摘要

背景

刺猬（Hh）信号通路在弥漫性大 B 细胞淋巴瘤（DLBCL）中被激活，有助于促进肿瘤细胞的存活和增殖。目前，Hh 信号通路在 DLBCL 预后中的作用尚未得到彻底研究。

方法

从 UCSC Xena 和 GEO 数据库中收集了 DLBCL 的 RNA-Seq 数据和 scRNA-seq 数据。构建了一个与 Hh 信号通路基因相关的预后模型，并进行了风险分层。系统地比较了不同风险组的免疫微环境特征、Hh 评分和药物敏感性差异。通过细胞通讯分析筛选了潜在的免疫调节配体 - 受体对。在此基础上，在 SU-DHL-4 细胞中敲低了在模型中贡献显著的基因 RABEP1。结合裸鼠皮下异种移植肿瘤模型，在体内和体外以及通路水平上验证了其促肿瘤效应和对 Hh 信号活动的影响。

结果

我们构建了一个基于具有高 Hh 评分的 Tregs、Tfh 和 CD8⁺ T 细胞的 11 基因预后模型，该模型在多个数据集中表现出良好的稳定性和预测能力。RABEP1 对风险评分的贡献显著，在 DLBCL 高危组中高表达，且与 AC220 的敏感性呈负相关。体外和体内实验表明，敲低 RABEP1 可以通过抑制 Hh 信号（GLI1/PTCH1）来抑制肿瘤生长并促进凋亡。

结论

通过整合多组学数据，我们开发了一个基于 Hh 相关基因的预后模型。基于对免疫细胞间细胞通讯的分析，我们鉴定了几个关键的受体 - 配体对。这些发现不仅为预测 DLBCL 预后提供了新的分子生物标志物，也为针对 Hh 信号通路的药物治疗研究提供了新的视角。