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整合 GWAS、eQTL 和功能验证鉴定 ZNF280B 为湖羊生长和胴体性状的关键调控因子

《BMC Genomics》:Integrative GWAS, eQTL, and functional validation identify ZNF280B as a key regulator of growth and carcass traits in Hu sheep

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月04日 来源:BMC Genomics 3.9

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   摘要湖羊是中国著名的兼用型品种,以其产肉性能、性成熟早、多产性高以及对湿热环境的适应能力而闻名。在本研究中,我们结合全基因组测序、GWAS 和 eQTL 分析,调查了 420 只 8 月龄湖羊生长和屠宰性状的遗传基础。利用发现队列(N?=?112)和验证队列(N?=?308)

  

摘要

湖羊是中国著名的兼用型品种,以其产肉性能、性成熟早、多产性高以及对湿热环境的适应能力而闻名。在本研究中,我们结合全基因组测序、GWAS 和 eQTL 分析,调查了 420 只 8 月龄湖羊生长和屠宰性状的遗传基础。利用发现队列(N?=?112)和验证队列(N?=?308),我们整合了高通量 SNP 基因分型和 RNA 测序,鉴定了 559,996 个高质量 SNP 以及多个与活重和胴体重等性状显著相关的位点。在检测到的 2,368 个 cis-eQTL 中,最显著的一个与腰最长肌中ZNF280B的表达相关。功能验证表明,ZNF280B下调显著抑制了骨骼肌卫星细胞的增殖并诱导细胞凋亡,突显了其在肌肉发育和脂肪代谢中的关键作用。本研究的创新之处在于其大样本量、全面的多性状分析以及功能验证的整合,为湖羊的分子标记辅助选择提供了可靠的遗传标记。这些发现加深了我们对生长和屠宰性能遗传机制的理解,并为提高生产效率和促进畜牧业可持续发展提供了有价值的见解。

湖羊是中国著名的兼用型品种,以其产肉性能、性成熟早、多产性高以及对湿热环境的适应能力而闻名。在本研究中,我们结合全基因组测序、GWAS 和 eQTL 分析,调查了 420 只 8 月龄湖羊生长和屠宰性状的遗传基础。利用发现队列(N?=?112)和验证队列(N?=?308),我们整合了高通量 SNP 基因分型和 RNA 测序,鉴定了 559,996 个高质量 SNP 以及多个与活重和胴体重等性状显著相关的位点。在检测到的 2,368 个 cis-eQTL 中,最显著的一个与腰最长肌中ZNF280B的表达相关。功能验证表明,ZNF280B下调显著抑制了骨骼肌卫星细胞的增殖并诱导细胞凋亡,突显了其在肌肉发育和脂肪代谢中的关键作用。本研究的创新之处在于其大样本量、全面的多性状分析以及功能验证的整合,为湖羊的分子标记辅助选择提供了可靠的遗传标记。这些发现加深了我们对生长和屠宰性能遗传机制的理解,并为提高生产效率和促进畜牧业可持续发展提供了有价值的见解。

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