与绒山羊胚胎毛囊发育相关的细胞质lncRNA MSTRG.18075.2：真皮成纤维细胞表型及候选chi-miR-145-5p/WNT16调控轴

《BMC Genomics》：Cytoplasmic lncRNA MSTRG.18075.2 associated with embryonic hair follicle development in cashmere goats: dermal fibroblast phenotypes and a candidate chi-miR-145-5p/WNT16 regulatory axis

　　

摘要

背景

长链非编码 RNA（lncRNAs）是发育基因表达的重要调节因子，但它们在绒山羊胚胎毛囊形态发生的关键时期中的作用尚不清楚。本研究旨在鉴定与早期毛囊发育相关的时空特异性 lncRNAs，并评估一种候选细胞质 lncRNA 及其在体外真皮成纤维细胞模型中的潜在调节关系。

结果

时间筛选鉴定了 32 个候选 lncRNAs，它们在胚胎第 55 天表现出短暂、阶段特异性的表达变化，表明该阶段可能代表与胚胎毛囊形态发生相关的重要转录调节窗口。富集分析显示，在第 55 天与第 45 天以及第 65 天与第 55 天的比较中，Wnt 相关基因集呈正富集；然而，这一发现并不构成对 Wnt 通路活性的直接测量。在优先候选者中，MSTRG.18075.2 在第 55 天显示出相对较高的表达，且主要定位在细胞质中。在异源 293T 细胞报告系统中，chi-miR-145-5p 降低了含有预测的 MSTRG.18075.2 或 WNT16 3' UTR 位点的野生型报告因子的活性，而相应的突变型报告因子未显示相同的变化，支持由这些预测位点介导的序列特异性报告因子反应。在绒山羊真皮成纤维细胞中，MSTRG.18075.2 敲低与凋亡减少、细胞周期进展减慢、增殖和迁移受损以及细胞内活性氧（ROS）增加有关。chi-miR-145-5p 的联合敲低部分逆转了由 MSTRG.18075.2 或 WNT16 敲低诱导的一些表型。这些结果与候选的 MSTRG.18075.2/chi-miR-145-5p/WNT16 调节模型一致。

结论

本研究在时间表达、细胞质定位、序列特异性报告因子反应和体外细胞表型水平上，为 MSTRG.18075.2 与候选 chi-miR-145-5p/WNT16 调节轴之间的关系提供了支持证据。由于未检查内源性 RNA 复合物、下游 Wnt 活性以及体内对毛囊形态发生的影响，目前的发现并未直接建立内源性 ceRNA 机制或体内的因果关系。