源自中国一例致死性人类病例的日本立克次体 YC21 株：比较基因组学与感染表型的实验表征

《BMC Microbiology》：Rickettsia japonica strain YC21 from a fatal human case in China: comparative genomics and experimental characterization of infection phenotypes

　　

摘要

背景

日本立克次体 引起日本斑点热 (JSF)，这是东亚新兴的一种严重蜱传疾病。我们最近从中国首例实验室确诊的致命性 JSF 病例中分离出了 YC21 株。本研究旨在表征这种单一临床来源分离株的基因组特征和感染表型，而不是为了确定其相对毒力。

结果

在系统发育上，YC21 聚类于第 III 支系，该支系包含所有中国分离株和一个日本株。第 II 和第 III 支系共享黏附蛋白基因 rOmpB/Sca5 中一个保守的 15 个碱基对缺失。YC21 基因组存在变异，包括在分析的数据集中确定的两个 YC21 特异性单核苷酸多态性 (SNPs) 以及表面抗原基因的改变。在体外，在标准化的 Vero 细胞实验条件下，YC21 显示出比选定的斑点热群 (SFG) 参考株更高的基于 qPCR 的立克次体 DNA 负荷。在体内，YC21 感染在 C3H/HeN 小鼠中引起了临床疾病、多种组织中基于 qPCR 的立克次体 DNA 负荷以及肝脏和肺部病变。

结论

本研究提供了一个来自致命性人类病例的单一中国日本立克次体分离株的基因组和实验表征。此处确定的基因组变异应被视为需要功能验证的候选特征。需要利用额外的日本立克次体株进行进一步的比较研究，以确定这些特征是否导致了感染表型或疾病严重程度方面的株水平差异。