耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌肺炎的临床特征、微生物共检测谱及28天死亡率：一项基于mNGS耐药基因检测的回顾性研究

《BMC Infectious Diseases》：Clinical features, microbial co-detection profiles, and 28-day mortality of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae pneumonia: a retrospective study with mNGS-based resistance gene detection

　　

摘要

背景

碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）引起的肺部感染与高死亡率相关。本研究比较了 CRKP 患者与碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌（CSKP）患者的临床特征、微生物共同检测谱及预后。此外，采用宏基因组下一代测序（mNGS）进行耐药基因检测，并确定了 CRKP 患者 28 天死亡的风险因素。

方法

本研究回顾性纳入了 158 例肺炎克雷伯菌肺部感染患者（81 例 CRKP 和 77 例 CSKP）。比较了两组患者的临床数据、实验室检查结果和病原体谱。以基于培养的抗菌药物敏感性试验（AST）为标准，评估了 mNGS 的诊断性能。采用 LASSO 回归和多变量逻辑回归确定 CRKP 患者 28 天死亡的独立风险因素。

结果

各组基线特征相似。CRKP 患者更常患有呼吸困难（53.1% vs. 35.1%, P?=?0.034），且白细胞计数较高（P?=?0.035）。基于 mNGS 的额外微生物共同检测（尤其是鲍曼不动杆菌）在 CRKP 患者中显著多于 CSKP 患者（43.2% vs. 24.7%, P?=?0.022）。mNGS 结果显示，碳青霉烯类耐药基因检测的总体准确率为 93.06%，敏感性为 87.65%，其中 blaKPC 被确定为主要的耐药基因（n?=?72）。CRKP 感染与显著更高的机械通气率（P?<?0.001）、更长的 ICU 住院时间（P?=?0.001）和更高的院内死亡率（27.2% vs. 6.5%, P?=?0.001）相关。纤维蛋白原（OR?=?0.45, P?=?0.019）和 IL-6（每增加 100 单位 OR?=?1.08, P?=?0.036）被确定为 CRKP 患者 28 天死亡的独立预测因子。

结论

与 CSKP 相比，CRKP 引起的肺部感染带来显著的疾病负担，其特征为微生物共同检测率更高、资源消耗增加和死亡率更高。mNGS 技术可作为检测碳青霉烯类耐药基因的传统诊断的补充策略。纤维蛋白原和 IL-6 可作为临床上易于获取的生物标志物，用于分层 CRKP 患者 28 天死亡相关的风险。